Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZS1

POLR1E, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA49, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR1EQ9GZS1 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
POLR1EQ9GZS1 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
POLR1EQ9GZS1 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
POLR1EQ9GZS1 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
POLR1EQ9GZS1 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
POLR1EQ9GZS1 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
POLR1EQ9GZS1 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
POLR1EQ9GZS1 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
POLR1EQ9GZS1 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
POLR1EQ9GZS1 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
POLR1EQ9GZS1 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
POLR1EQ9GZS1 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
POLR1EQ9GZS1 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
POLR1EQ9GZS1 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
POLR1EQ9GZS1 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
POLR1EQ9GZS1 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
POLR1EQ9GZS1 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
POLR1EQ9GZS1 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
POLR1EQ9GZS1 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
POLR1EQ9GZS1 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
POLR1EQ9GZS1 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
POLR1EQ9GZS1 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
POLR1EQ9GZS1 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
POLR1EQ9GZS1 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
POLR1EQ9GZS1 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
POLR1EQ9GZS1 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
POLR1EQ9GZS1 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
POLR1EQ9GZS1 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
POLR1EQ9GZS1 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
POLR1EQ9GZS1 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
POLR1EQ9GZS1 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
POLR1EQ9GZS1 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
POLR1EQ9GZS1 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
POLR1EQ9GZS1 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
POLR1EQ9GZS1 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
POLR1EQ9GZS1 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
POLR1EQ9GZS1 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
POLR1EQ9GZS1 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
POLR1EQ9GZS1 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
POLR1EQ9GZS1 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
POLR1EQ9GZS1 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
POLR1EQ9GZS1 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
POLR1EQ9GZS1 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
POLR1EQ9GZS1 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
POLR1EQ9GZS1 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
POLR1EQ9GZS1 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
POLR1EQ9GZS1 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
POLR1EQ9GZS1 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
POLR1EQ9GZS1 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
POLR1EQ9GZS1 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
POLR1EQ9GZS1 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
POLR1EQ9GZS1 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
POLR1EQ9GZS1 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
POLR1EQ9GZS1 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
POLR1EQ9GZS1 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
POLR1EQ9GZS1 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
POLR1EQ9GZS1 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
POLR1EQ9GZS1 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
POLR1EQ9GZS1 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
POLR1EQ9GZS1 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
POLR1EQ9GZS1 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
POLR1EQ9GZS1 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
POLR1EQ9GZS1 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
POLR1EQ9GZS1 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
POLR1EQ9GZS1 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
POLR1EQ9GZS1 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
POLR1EQ9GZS1 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
POLR1EQ9GZS1 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
POLR1EQ9GZS1 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
POLR1EQ9GZS1 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
POLR1EQ9GZS1 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
POLR1EQ9GZS1 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
POLR1EQ9GZS1 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
POLR1EQ9GZS1 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
POLR1EQ9GZS1 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
POLR1EQ9GZS1 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
POLR1EQ9GZS1 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
POLR1EQ9GZS1 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
POLR1EQ9GZS1 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
POLR1EQ9GZS1 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
POLR1EQ9GZS1 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
POLR1EQ9GZS1 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
POLR1EQ9GZS1 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
POLR1EQ9GZS1 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
POLR1EQ9GZS1 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
POLR1EQ9GZS1 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
POLR1EQ9GZS1 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
POLR1EQ9GZS1 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
POLR1EQ9GZS1 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
POLR1EQ9GZS1 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
POLR1EQ9GZS1 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
POLR1EQ9GZS1 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
POLR1EQ9GZS1 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
POLR1EQ9GZS1 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
POLR1EQ9GZS1 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
POLR1EQ9GZS1 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
POLR1EQ9GZS1 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
POLR1EQ9GZS1 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
POLR1EQ9GZS1 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
POLR1EQ9GZS1 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.2 ms