Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0F1

CEP44, Centrosomal protein of 44 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP44Q9C0F1 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
CEP44Q9C0F1 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CEP44Q9C0F1 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CEP44Q9C0F1 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CEP44Q9C0F1 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CEP44Q9C0F1 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
CEP44Q9C0F1 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CEP44Q9C0F1 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
CEP44Q9C0F1 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CEP44Q9C0F1 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CEP44Q9C0F1 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CEP44Q9C0F1 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CEP44Q9C0F1 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CEP44Q9C0F1 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CEP44Q9C0F1 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
CEP44Q9C0F1 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CEP44Q9C0F1 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
CEP44Q9C0F1 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CEP44Q9C0F1 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CEP44Q9C0F1 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
CEP44Q9C0F1 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
CEP44Q9C0F1 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CEP44Q9C0F1 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CEP44Q9C0F1 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CEP44Q9C0F1 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CEP44Q9C0F1 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CEP44Q9C0F1 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CEP44Q9C0F1 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CEP44Q9C0F1 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CEP44Q9C0F1 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CEP44Q9C0F1 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CEP44Q9C0F1 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CEP44Q9C0F1 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CEP44Q9C0F1 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CEP44Q9C0F1 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CEP44Q9C0F1 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CEP44Q9C0F1 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CEP44Q9C0F1 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CEP44Q9C0F1 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CEP44Q9C0F1 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CEP44Q9C0F1 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CEP44Q9C0F1 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CEP44Q9C0F1 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
CEP44Q9C0F1 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CEP44Q9C0F1 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CEP44Q9C0F1 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CEP44Q9C0F1 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CEP44Q9C0F1 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
CEP44Q9C0F1 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CEP44Q9C0F1 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CEP44Q9C0F1 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CEP44Q9C0F1 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CEP44Q9C0F1 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CEP44Q9C0F1 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CEP44Q9C0F1 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CEP44Q9C0F1 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CEP44Q9C0F1 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CEP44Q9C0F1 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CEP44Q9C0F1 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CEP44Q9C0F1 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CEP44Q9C0F1 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CEP44Q9C0F1 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CEP44Q9C0F1 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
CEP44Q9C0F1 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
CEP44Q9C0F1 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CEP44Q9C0F1 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CEP44Q9C0F1 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CEP44Q9C0F1 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CEP44Q9C0F1 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CEP44Q9C0F1 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CEP44Q9C0F1 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CEP44Q9C0F1 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CEP44Q9C0F1 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CEP44Q9C0F1 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CEP44Q9C0F1 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CEP44Q9C0F1 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CEP44Q9C0F1 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CEP44Q9C0F1 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CEP44Q9C0F1 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CEP44Q9C0F1 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CEP44Q9C0F1 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CEP44Q9C0F1 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CEP44Q9C0F1 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CEP44Q9C0F1 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CEP44Q9C0F1 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CEP44Q9C0F1 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CEP44Q9C0F1 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CEP44Q9C0F1 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CEP44Q9C0F1 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
CEP44Q9C0F1 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CEP44Q9C0F1 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
CEP44Q9C0F1 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CEP44Q9C0F1 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CEP44Q9C0F1 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
CEP44Q9C0F1 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CEP44Q9C0F1 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CEP44Q9C0F1 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CEP44Q9C0F1 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CEP44Q9C0F1 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CEP44Q9C0F1 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms