Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZ76

CNTNAP3, Contactin-associated protein-like 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTNAP3Q9BZ76 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CNTNAP3Q9BZ76 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CNTNAP3Q9BZ76 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CNTNAP3Q9BZ76 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CNTNAP3Q9BZ76 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CNTNAP3Q9BZ76 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CNTNAP3Q9BZ76 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CNTNAP3Q9BZ76 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CNTNAP3Q9BZ76 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CNTNAP3Q9BZ76 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CNTNAP3Q9BZ76 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CNTNAP3Q9BZ76 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CNTNAP3Q9BZ76 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CNTNAP3Q9BZ76 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CNTNAP3Q9BZ76 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CNTNAP3Q9BZ76 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CNTNAP3Q9BZ76 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CNTNAP3Q9BZ76 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CNTNAP3Q9BZ76 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CNTNAP3Q9BZ76 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CNTNAP3Q9BZ76 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CNTNAP3Q9BZ76 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CNTNAP3Q9BZ76 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
CNTNAP3Q9BZ76 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CNTNAP3Q9BZ76 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CNTNAP3Q9BZ76 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CNTNAP3Q9BZ76 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CNTNAP3Q9BZ76 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CNTNAP3Q9BZ76 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CNTNAP3Q9BZ76 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CNTNAP3Q9BZ76 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CNTNAP3Q9BZ76 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CNTNAP3Q9BZ76 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CNTNAP3Q9BZ76 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CNTNAP3Q9BZ76 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CNTNAP3Q9BZ76 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CNTNAP3Q9BZ76 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CNTNAP3Q9BZ76 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CNTNAP3Q9BZ76 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CNTNAP3Q9BZ76 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CNTNAP3Q9BZ76 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CNTNAP3Q9BZ76 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CNTNAP3Q9BZ76 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CNTNAP3Q9BZ76 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CNTNAP3Q9BZ76 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CNTNAP3Q9BZ76 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CNTNAP3Q9BZ76 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CNTNAP3Q9BZ76 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CNTNAP3Q9BZ76 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
CNTNAP3Q9BZ76 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CNTNAP3Q9BZ76 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CNTNAP3Q9BZ76 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CNTNAP3Q9BZ76 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CNTNAP3Q9BZ76 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CNTNAP3Q9BZ76 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CNTNAP3Q9BZ76 VAMP4-202ENST00000367740 1193 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CNTNAP3Q9BZ76 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CNTNAP3Q9BZ76 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CNTNAP3Q9BZ76 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CNTNAP3Q9BZ76 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CNTNAP3Q9BZ76 LINC00351-201ENST00000424926 911 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CNTNAP3Q9BZ76 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CNTNAP3Q9BZ76 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CNTNAP3Q9BZ76 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
CNTNAP3Q9BZ76 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CNTNAP3Q9BZ76 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CNTNAP3Q9BZ76 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CNTNAP3Q9BZ76 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CNTNAP3Q9BZ76 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CNTNAP3Q9BZ76 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
CNTNAP3Q9BZ76 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
CNTNAP3Q9BZ76 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CNTNAP3Q9BZ76 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CNTNAP3Q9BZ76 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CNTNAP3Q9BZ76 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CNTNAP3Q9BZ76 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CNTNAP3Q9BZ76 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CNTNAP3Q9BZ76 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CNTNAP3Q9BZ76 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CNTNAP3Q9BZ76 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CNTNAP3Q9BZ76 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CNTNAP3Q9BZ76 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CNTNAP3Q9BZ76 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CNTNAP3Q9BZ76 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CNTNAP3Q9BZ76 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CNTNAP3Q9BZ76 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CNTNAP3Q9BZ76 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CNTNAP3Q9BZ76 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CNTNAP3Q9BZ76 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
CNTNAP3Q9BZ76 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CNTNAP3Q9BZ76 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CNTNAP3Q9BZ76 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CNTNAP3Q9BZ76 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CNTNAP3Q9BZ76 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CNTNAP3Q9BZ76 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CNTNAP3Q9BZ76 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CNTNAP3Q9BZ76 NAA50-208ENST00000497255 789 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CNTNAP3Q9BZ76 LEPROTL1-204ENST00000518192 847 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CNTNAP3Q9BZ76 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CNTNAP3Q9BZ76 AC015712.4-202ENST00000558641 1007 ntTSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.7 ms