Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXA9

SALL3, Sal-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,300 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SALL3Q9BXA9 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SALL3Q9BXA9 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SALL3Q9BXA9 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SALL3Q9BXA9 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SALL3Q9BXA9 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SALL3Q9BXA9 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SALL3Q9BXA9 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SALL3Q9BXA9 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SALL3Q9BXA9 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SALL3Q9BXA9 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SALL3Q9BXA9 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SALL3Q9BXA9 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SALL3Q9BXA9 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SALL3Q9BXA9 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
SALL3Q9BXA9 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SALL3Q9BXA9 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SALL3Q9BXA9 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SALL3Q9BXA9 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SALL3Q9BXA9 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SALL3Q9BXA9 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SALL3Q9BXA9 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SALL3Q9BXA9 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SALL3Q9BXA9 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SALL3Q9BXA9 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SALL3Q9BXA9 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SALL3Q9BXA9 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
SALL3Q9BXA9 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SALL3Q9BXA9 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SALL3Q9BXA9 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SALL3Q9BXA9 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SALL3Q9BXA9 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SALL3Q9BXA9 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SALL3Q9BXA9 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SALL3Q9BXA9 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SALL3Q9BXA9 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SALL3Q9BXA9 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SALL3Q9BXA9 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
SALL3Q9BXA9 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SALL3Q9BXA9 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SALL3Q9BXA9 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
SALL3Q9BXA9 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SALL3Q9BXA9 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SALL3Q9BXA9 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SALL3Q9BXA9 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SALL3Q9BXA9 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SALL3Q9BXA9 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SALL3Q9BXA9 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SALL3Q9BXA9 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SALL3Q9BXA9 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SALL3Q9BXA9 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SALL3Q9BXA9 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SALL3Q9BXA9 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SALL3Q9BXA9 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SALL3Q9BXA9 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SALL3Q9BXA9 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SALL3Q9BXA9 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SALL3Q9BXA9 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SALL3Q9BXA9 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SALL3Q9BXA9 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SALL3Q9BXA9 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SALL3Q9BXA9 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SALL3Q9BXA9 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SALL3Q9BXA9 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SALL3Q9BXA9 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SALL3Q9BXA9 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SALL3Q9BXA9 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SALL3Q9BXA9 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SALL3Q9BXA9 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SALL3Q9BXA9 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SALL3Q9BXA9 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SALL3Q9BXA9 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SALL3Q9BXA9 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SALL3Q9BXA9 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SALL3Q9BXA9 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
SALL3Q9BXA9 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SALL3Q9BXA9 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SALL3Q9BXA9 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SALL3Q9BXA9 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SALL3Q9BXA9 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
SALL3Q9BXA9 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
SALL3Q9BXA9 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SALL3Q9BXA9 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SALL3Q9BXA9 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SALL3Q9BXA9 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SALL3Q9BXA9 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SALL3Q9BXA9 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SALL3Q9BXA9 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SALL3Q9BXA9 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SALL3Q9BXA9 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SALL3Q9BXA9 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SALL3Q9BXA9 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SALL3Q9BXA9 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SALL3Q9BXA9 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SALL3Q9BXA9 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SALL3Q9BXA9 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SALL3Q9BXA9 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SALL3Q9BXA9 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SALL3Q9BXA9 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SALL3Q9BXA9 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SALL3Q9BXA9 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms