Protein–RNA interactions for Protein: Q9BWU1

CDK19, Cyclin-dependent kinase 19, humanhuman

Predictions only

Length 502 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK19Q9BWU1 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
CDK19Q9BWU1 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CDK19Q9BWU1 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CDK19Q9BWU1 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CDK19Q9BWU1 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CDK19Q9BWU1 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CDK19Q9BWU1 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CDK19Q9BWU1 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CDK19Q9BWU1 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CDK19Q9BWU1 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CDK19Q9BWU1 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CDK19Q9BWU1 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CDK19Q9BWU1 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CDK19Q9BWU1 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CDK19Q9BWU1 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CDK19Q9BWU1 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CDK19Q9BWU1 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CDK19Q9BWU1 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CDK19Q9BWU1 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CDK19Q9BWU1 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CDK19Q9BWU1 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CDK19Q9BWU1 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CDK19Q9BWU1 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CDK19Q9BWU1 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CDK19Q9BWU1 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CDK19Q9BWU1 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CDK19Q9BWU1 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CDK19Q9BWU1 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
CDK19Q9BWU1 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CDK19Q9BWU1 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
CDK19Q9BWU1 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
CDK19Q9BWU1 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CDK19Q9BWU1 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
CDK19Q9BWU1 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CDK19Q9BWU1 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
CDK19Q9BWU1 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CDK19Q9BWU1 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CDK19Q9BWU1 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CDK19Q9BWU1 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CDK19Q9BWU1 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CDK19Q9BWU1 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CDK19Q9BWU1 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CDK19Q9BWU1 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CDK19Q9BWU1 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CDK19Q9BWU1 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CDK19Q9BWU1 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CDK19Q9BWU1 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CDK19Q9BWU1 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CDK19Q9BWU1 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CDK19Q9BWU1 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CDK19Q9BWU1 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CDK19Q9BWU1 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CDK19Q9BWU1 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CDK19Q9BWU1 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CDK19Q9BWU1 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CDK19Q9BWU1 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CDK19Q9BWU1 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CDK19Q9BWU1 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CDK19Q9BWU1 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CDK19Q9BWU1 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CDK19Q9BWU1 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CDK19Q9BWU1 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CDK19Q9BWU1 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CDK19Q9BWU1 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CDK19Q9BWU1 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CDK19Q9BWU1 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CDK19Q9BWU1 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CDK19Q9BWU1 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CDK19Q9BWU1 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CDK19Q9BWU1 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CDK19Q9BWU1 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CDK19Q9BWU1 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CDK19Q9BWU1 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
CDK19Q9BWU1 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
CDK19Q9BWU1 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
CDK19Q9BWU1 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
CDK19Q9BWU1 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CDK19Q9BWU1 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CDK19Q9BWU1 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
CDK19Q9BWU1 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CDK19Q9BWU1 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CDK19Q9BWU1 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CDK19Q9BWU1 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CDK19Q9BWU1 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CDK19Q9BWU1 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CDK19Q9BWU1 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
CDK19Q9BWU1 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CDK19Q9BWU1 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CDK19Q9BWU1 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CDK19Q9BWU1 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CDK19Q9BWU1 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CDK19Q9BWU1 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CDK19Q9BWU1 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CDK19Q9BWU1 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CDK19Q9BWU1 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CDK19Q9BWU1 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CDK19Q9BWU1 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CDK19Q9BWU1 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CDK19Q9BWU1 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CDK19Q9BWU1 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms