Protein–RNA interactions for Protein: Q9BU64

CENPO, Centromere protein O, humanhuman

Predictions only

Length 300 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPOQ9BU64 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CENPOQ9BU64 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CENPOQ9BU64 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CENPOQ9BU64 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CENPOQ9BU64 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CENPOQ9BU64 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CENPOQ9BU64 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CENPOQ9BU64 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CENPOQ9BU64 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CENPOQ9BU64 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CENPOQ9BU64 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CENPOQ9BU64 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CENPOQ9BU64 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
CENPOQ9BU64 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CENPOQ9BU64 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CENPOQ9BU64 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CENPOQ9BU64 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CENPOQ9BU64 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CENPOQ9BU64 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CENPOQ9BU64 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CENPOQ9BU64 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CENPOQ9BU64 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CENPOQ9BU64 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CENPOQ9BU64 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CENPOQ9BU64 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CENPOQ9BU64 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CENPOQ9BU64 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CENPOQ9BU64 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CENPOQ9BU64 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CENPOQ9BU64 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CENPOQ9BU64 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CENPOQ9BU64 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CENPOQ9BU64 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CENPOQ9BU64 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CENPOQ9BU64 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CENPOQ9BU64 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CENPOQ9BU64 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CENPOQ9BU64 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CENPOQ9BU64 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CENPOQ9BU64 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CENPOQ9BU64 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CENPOQ9BU64 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CENPOQ9BU64 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CENPOQ9BU64 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CENPOQ9BU64 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
CENPOQ9BU64 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CENPOQ9BU64 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CENPOQ9BU64 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CENPOQ9BU64 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CENPOQ9BU64 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CENPOQ9BU64 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CENPOQ9BU64 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CENPOQ9BU64 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CENPOQ9BU64 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CENPOQ9BU64 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CENPOQ9BU64 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CENPOQ9BU64 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
CENPOQ9BU64 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CENPOQ9BU64 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CENPOQ9BU64 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CENPOQ9BU64 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CENPOQ9BU64 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CENPOQ9BU64 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CENPOQ9BU64 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CENPOQ9BU64 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CENPOQ9BU64 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CENPOQ9BU64 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CENPOQ9BU64 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CENPOQ9BU64 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CENPOQ9BU64 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CENPOQ9BU64 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CENPOQ9BU64 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CENPOQ9BU64 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CENPOQ9BU64 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CENPOQ9BU64 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CENPOQ9BU64 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CENPOQ9BU64 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
CENPOQ9BU64 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CENPOQ9BU64 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CENPOQ9BU64 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
CENPOQ9BU64 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CENPOQ9BU64 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CENPOQ9BU64 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CENPOQ9BU64 CMTM6-201ENST00000205636 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CENPOQ9BU64 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CENPOQ9BU64 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CENPOQ9BU64 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
CENPOQ9BU64 ASF1A-201ENST00000229595 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CENPOQ9BU64 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CENPOQ9BU64 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CENPOQ9BU64 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CENPOQ9BU64 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CENPOQ9BU64 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CENPOQ9BU64 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CENPOQ9BU64 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CENPOQ9BU64 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CENPOQ9BU64 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CENPOQ9BU64 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CENPOQ9BU64 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CENPOQ9BU64 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.3 ms