Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTX1

NDC1, Nucleoporin NDC1, humanhuman

Predictions only

Length 674 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDC1Q9BTX1 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NDC1Q9BTX1 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
NDC1Q9BTX1 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NDC1Q9BTX1 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NDC1Q9BTX1 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NDC1Q9BTX1 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NDC1Q9BTX1 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
NDC1Q9BTX1 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NDC1Q9BTX1 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
NDC1Q9BTX1 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NDC1Q9BTX1 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
NDC1Q9BTX1 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NDC1Q9BTX1 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NDC1Q9BTX1 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NDC1Q9BTX1 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NDC1Q9BTX1 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
NDC1Q9BTX1 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
NDC1Q9BTX1 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
NDC1Q9BTX1 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
NDC1Q9BTX1 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
NDC1Q9BTX1 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
NDC1Q9BTX1 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
NDC1Q9BTX1 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
NDC1Q9BTX1 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
NDC1Q9BTX1 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
NDC1Q9BTX1 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
NDC1Q9BTX1 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
NDC1Q9BTX1 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
NDC1Q9BTX1 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
NDC1Q9BTX1 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
NDC1Q9BTX1 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
NDC1Q9BTX1 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
NDC1Q9BTX1 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
NDC1Q9BTX1 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
NDC1Q9BTX1 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
NDC1Q9BTX1 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
NDC1Q9BTX1 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.35
NDC1Q9BTX1 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
NDC1Q9BTX1 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
NDC1Q9BTX1 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
NDC1Q9BTX1 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
NDC1Q9BTX1 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
NDC1Q9BTX1 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
NDC1Q9BTX1 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
NDC1Q9BTX1 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
NDC1Q9BTX1 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
NDC1Q9BTX1 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
NDC1Q9BTX1 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
NDC1Q9BTX1 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
NDC1Q9BTX1 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
NDC1Q9BTX1 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
NDC1Q9BTX1 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
NDC1Q9BTX1 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
NDC1Q9BTX1 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
NDC1Q9BTX1 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
NDC1Q9BTX1 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
NDC1Q9BTX1 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
NDC1Q9BTX1 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
NDC1Q9BTX1 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
NDC1Q9BTX1 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
NDC1Q9BTX1 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
NDC1Q9BTX1 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
NDC1Q9BTX1 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC17.26■□□□□ 0.35
NDC1Q9BTX1 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
NDC1Q9BTX1 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
NDC1Q9BTX1 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
NDC1Q9BTX1 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
NDC1Q9BTX1 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
NDC1Q9BTX1 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
NDC1Q9BTX1 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
NDC1Q9BTX1 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
NDC1Q9BTX1 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
NDC1Q9BTX1 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
NDC1Q9BTX1 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
NDC1Q9BTX1 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
NDC1Q9BTX1 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
NDC1Q9BTX1 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
NDC1Q9BTX1 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
NDC1Q9BTX1 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
NDC1Q9BTX1 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
NDC1Q9BTX1 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
NDC1Q9BTX1 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
NDC1Q9BTX1 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NDC1Q9BTX1 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NDC1Q9BTX1 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NDC1Q9BTX1 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NDC1Q9BTX1 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NDC1Q9BTX1 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NDC1Q9BTX1 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
NDC1Q9BTX1 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
NDC1Q9BTX1 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NDC1Q9BTX1 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NDC1Q9BTX1 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NDC1Q9BTX1 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NDC1Q9BTX1 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NDC1Q9BTX1 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NDC1Q9BTX1 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NDC1Q9BTX1 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NDC1Q9BTX1 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
NDC1Q9BTX1 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.8 ms