Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSE4

HERPUD2, Homocysteine-responsive endoplasmic reticulum-resident ubiquitin-like domain member 2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERPUD2Q9BSE4 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
HERPUD2Q9BSE4 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
HERPUD2Q9BSE4 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
HERPUD2Q9BSE4 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
HERPUD2Q9BSE4 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
HERPUD2Q9BSE4 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
HERPUD2Q9BSE4 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
HERPUD2Q9BSE4 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
HERPUD2Q9BSE4 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
HERPUD2Q9BSE4 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
HERPUD2Q9BSE4 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
HERPUD2Q9BSE4 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
HERPUD2Q9BSE4 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
HERPUD2Q9BSE4 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
HERPUD2Q9BSE4 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
HERPUD2Q9BSE4 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
HERPUD2Q9BSE4 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
HERPUD2Q9BSE4 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
HERPUD2Q9BSE4 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
HERPUD2Q9BSE4 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
HERPUD2Q9BSE4 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
HERPUD2Q9BSE4 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
HERPUD2Q9BSE4 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
HERPUD2Q9BSE4 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
HERPUD2Q9BSE4 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
HERPUD2Q9BSE4 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
HERPUD2Q9BSE4 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
HERPUD2Q9BSE4 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
HERPUD2Q9BSE4 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
HERPUD2Q9BSE4 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
HERPUD2Q9BSE4 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
HERPUD2Q9BSE4 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
HERPUD2Q9BSE4 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
HERPUD2Q9BSE4 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
HERPUD2Q9BSE4 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
HERPUD2Q9BSE4 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
HERPUD2Q9BSE4 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
HERPUD2Q9BSE4 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
HERPUD2Q9BSE4 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
HERPUD2Q9BSE4 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
HERPUD2Q9BSE4 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
HERPUD2Q9BSE4 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
HERPUD2Q9BSE4 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
HERPUD2Q9BSE4 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
HERPUD2Q9BSE4 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
HERPUD2Q9BSE4 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
HERPUD2Q9BSE4 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
HERPUD2Q9BSE4 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
HERPUD2Q9BSE4 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
HERPUD2Q9BSE4 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
HERPUD2Q9BSE4 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
HERPUD2Q9BSE4 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC18.73■□□□□ 0.59
HERPUD2Q9BSE4 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
HERPUD2Q9BSE4 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
HERPUD2Q9BSE4 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
HERPUD2Q9BSE4 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
HERPUD2Q9BSE4 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
HERPUD2Q9BSE4 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
HERPUD2Q9BSE4 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
HERPUD2Q9BSE4 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
HERPUD2Q9BSE4 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
HERPUD2Q9BSE4 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
HERPUD2Q9BSE4 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
HERPUD2Q9BSE4 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
HERPUD2Q9BSE4 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
HERPUD2Q9BSE4 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
HERPUD2Q9BSE4 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
HERPUD2Q9BSE4 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
HERPUD2Q9BSE4 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
HERPUD2Q9BSE4 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
HERPUD2Q9BSE4 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.72■□□□□ 0.59
HERPUD2Q9BSE4 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
HERPUD2Q9BSE4 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
HERPUD2Q9BSE4 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
HERPUD2Q9BSE4 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
HERPUD2Q9BSE4 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
HERPUD2Q9BSE4 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
HERPUD2Q9BSE4 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
HERPUD2Q9BSE4 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
HERPUD2Q9BSE4 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
HERPUD2Q9BSE4 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
HERPUD2Q9BSE4 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
HERPUD2Q9BSE4 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
HERPUD2Q9BSE4 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
HERPUD2Q9BSE4 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
HERPUD2Q9BSE4 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
HERPUD2Q9BSE4 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
HERPUD2Q9BSE4 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
HERPUD2Q9BSE4 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
HERPUD2Q9BSE4 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
HERPUD2Q9BSE4 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
HERPUD2Q9BSE4 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
HERPUD2Q9BSE4 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
HERPUD2Q9BSE4 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
HERPUD2Q9BSE4 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
HERPUD2Q9BSE4 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
HERPUD2Q9BSE4 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
HERPUD2Q9BSE4 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
HERPUD2Q9BSE4 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
HERPUD2Q9BSE4 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.4 ms