Protein–RNA interactions for Protein: Q99743

NPAS2, Neuronal PAS domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 824 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPAS2Q99743 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NPAS2Q99743 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
NPAS2Q99743 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
NPAS2Q99743 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
NPAS2Q99743 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
NPAS2Q99743 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
NPAS2Q99743 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NPAS2Q99743 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC17.73■□□□□ 0.43
NPAS2Q99743 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
NPAS2Q99743 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NPAS2Q99743 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NPAS2Q99743 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NPAS2Q99743 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NPAS2Q99743 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NPAS2Q99743 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NPAS2Q99743 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NPAS2Q99743 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
NPAS2Q99743 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NPAS2Q99743 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
NPAS2Q99743 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
NPAS2Q99743 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NPAS2Q99743 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NPAS2Q99743 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NPAS2Q99743 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NPAS2Q99743 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NPAS2Q99743 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
NPAS2Q99743 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NPAS2Q99743 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NPAS2Q99743 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NPAS2Q99743 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NPAS2Q99743 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NPAS2Q99743 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NPAS2Q99743 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NPAS2Q99743 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
NPAS2Q99743 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.72■□□□□ 0.43
NPAS2Q99743 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NPAS2Q99743 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NPAS2Q99743 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
NPAS2Q99743 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
NPAS2Q99743 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
NPAS2Q99743 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
NPAS2Q99743 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
NPAS2Q99743 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
NPAS2Q99743 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NPAS2Q99743 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
NPAS2Q99743 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NPAS2Q99743 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NPAS2Q99743 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
NPAS2Q99743 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
NPAS2Q99743 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NPAS2Q99743 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NPAS2Q99743 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
NPAS2Q99743 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NPAS2Q99743 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NPAS2Q99743 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NPAS2Q99743 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NPAS2Q99743 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
NPAS2Q99743 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NPAS2Q99743 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NPAS2Q99743 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NPAS2Q99743 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NPAS2Q99743 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NPAS2Q99743 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
NPAS2Q99743 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NPAS2Q99743 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NPAS2Q99743 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
NPAS2Q99743 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
NPAS2Q99743 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
NPAS2Q99743 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NPAS2Q99743 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
NPAS2Q99743 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NPAS2Q99743 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NPAS2Q99743 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
NPAS2Q99743 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NPAS2Q99743 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
NPAS2Q99743 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
NPAS2Q99743 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NPAS2Q99743 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
NPAS2Q99743 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NPAS2Q99743 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
NPAS2Q99743 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
NPAS2Q99743 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NPAS2Q99743 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NPAS2Q99743 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
NPAS2Q99743 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
NPAS2Q99743 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NPAS2Q99743 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
NPAS2Q99743 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.42
NPAS2Q99743 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NPAS2Q99743 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
NPAS2Q99743 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NPAS2Q99743 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
NPAS2Q99743 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NPAS2Q99743 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NPAS2Q99743 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NPAS2Q99743 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
NPAS2Q99743 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NPAS2Q99743 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NPAS2Q99743 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NPAS2Q99743 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms