Protein–RNA interactions for Protein: Q96SW2

CRBN, Protein cereblon, humanhuman

Predictions only

Length 442 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRBNQ96SW2 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CRBNQ96SW2 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
CRBNQ96SW2 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CRBNQ96SW2 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CRBNQ96SW2 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CRBNQ96SW2 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
CRBNQ96SW2 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CRBNQ96SW2 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
CRBNQ96SW2 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CRBNQ96SW2 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CRBNQ96SW2 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CRBNQ96SW2 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CRBNQ96SW2 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
CRBNQ96SW2 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
CRBNQ96SW2 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.28
CRBNQ96SW2 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
CRBNQ96SW2 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CRBNQ96SW2 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
CRBNQ96SW2 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CRBNQ96SW2 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CRBNQ96SW2 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CRBNQ96SW2 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CRBNQ96SW2 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CRBNQ96SW2 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CRBNQ96SW2 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CRBNQ96SW2 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CRBNQ96SW2 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CRBNQ96SW2 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CRBNQ96SW2 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CRBNQ96SW2 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
CRBNQ96SW2 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CRBNQ96SW2 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CRBNQ96SW2 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
CRBNQ96SW2 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CRBNQ96SW2 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CRBNQ96SW2 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CRBNQ96SW2 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CRBNQ96SW2 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CRBNQ96SW2 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CRBNQ96SW2 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CRBNQ96SW2 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CRBNQ96SW2 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CRBNQ96SW2 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CRBNQ96SW2 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CRBNQ96SW2 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
CRBNQ96SW2 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CRBNQ96SW2 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CRBNQ96SW2 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CRBNQ96SW2 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CRBNQ96SW2 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CRBNQ96SW2 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CRBNQ96SW2 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CRBNQ96SW2 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CRBNQ96SW2 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CRBNQ96SW2 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
CRBNQ96SW2 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
CRBNQ96SW2 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CRBNQ96SW2 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
CRBNQ96SW2 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CRBNQ96SW2 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CRBNQ96SW2 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CRBNQ96SW2 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CRBNQ96SW2 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CRBNQ96SW2 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CRBNQ96SW2 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CRBNQ96SW2 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CRBNQ96SW2 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CRBNQ96SW2 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CRBNQ96SW2 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CRBNQ96SW2 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CRBNQ96SW2 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CRBNQ96SW2 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CRBNQ96SW2 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CRBNQ96SW2 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CRBNQ96SW2 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CRBNQ96SW2 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CRBNQ96SW2 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CRBNQ96SW2 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CRBNQ96SW2 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CRBNQ96SW2 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CRBNQ96SW2 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CRBNQ96SW2 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CRBNQ96SW2 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CRBNQ96SW2 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
CRBNQ96SW2 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CRBNQ96SW2 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CRBNQ96SW2 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CRBNQ96SW2 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CRBNQ96SW2 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CRBNQ96SW2 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CRBNQ96SW2 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CRBNQ96SW2 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CRBNQ96SW2 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CRBNQ96SW2 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CRBNQ96SW2 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CRBNQ96SW2 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CRBNQ96SW2 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CRBNQ96SW2 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CRBNQ96SW2 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CRBNQ96SW2 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms