Protein–RNA interactions for Protein: Q96LY2

CCDC74B, Coiled-coil domain-containing protein 74B, humanhuman

Predictions only

Length 380 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC74BQ96LY2 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC74BQ96LY2 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC74BQ96LY2 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC74BQ96LY2 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC74BQ96LY2 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC74BQ96LY2 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC74BQ96LY2 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC74BQ96LY2 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC74BQ96LY2 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC74BQ96LY2 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC74BQ96LY2 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC74BQ96LY2 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC74BQ96LY2 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC74BQ96LY2 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC74BQ96LY2 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC74BQ96LY2 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC74BQ96LY2 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC74BQ96LY2 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC74BQ96LY2 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC74BQ96LY2 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC74BQ96LY2 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC74BQ96LY2 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC74BQ96LY2 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC74BQ96LY2 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC74BQ96LY2 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC74BQ96LY2 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC74BQ96LY2 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC74BQ96LY2 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC74BQ96LY2 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC74BQ96LY2 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC74BQ96LY2 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC74BQ96LY2 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC74BQ96LY2 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC74BQ96LY2 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC74BQ96LY2 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC74BQ96LY2 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC74BQ96LY2 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC74BQ96LY2 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC74BQ96LY2 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC74BQ96LY2 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC74BQ96LY2 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC74BQ96LY2 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC74BQ96LY2 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC74BQ96LY2 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC74BQ96LY2 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC74BQ96LY2 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC74BQ96LY2 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC74BQ96LY2 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC74BQ96LY2 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC74BQ96LY2 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC74BQ96LY2 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC74BQ96LY2 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC74BQ96LY2 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC74BQ96LY2 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC74BQ96LY2 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC74BQ96LY2 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC74BQ96LY2 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC74BQ96LY2 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC74BQ96LY2 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC74BQ96LY2 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC74BQ96LY2 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC74BQ96LY2 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC74BQ96LY2 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC74BQ96LY2 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC74BQ96LY2 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC74BQ96LY2 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC74BQ96LY2 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC74BQ96LY2 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC74BQ96LY2 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC74BQ96LY2 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC74BQ96LY2 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC74BQ96LY2 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC74BQ96LY2 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC74BQ96LY2 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC74BQ96LY2 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC74BQ96LY2 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC74BQ96LY2 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC74BQ96LY2 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC74BQ96LY2 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC74BQ96LY2 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC74BQ96LY2 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC74BQ96LY2 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC74BQ96LY2 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC74BQ96LY2 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC74BQ96LY2 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC74BQ96LY2 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC74BQ96LY2 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC74BQ96LY2 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC74BQ96LY2 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC74BQ96LY2 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC74BQ96LY2 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC74BQ96LY2 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC74BQ96LY2 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC74BQ96LY2 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC74BQ96LY2 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC74BQ96LY2 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC74BQ96LY2 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC74BQ96LY2 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC74BQ96LY2 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC74BQ96LY2 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms