Protein–RNA interactions for Protein: Q96JB5

CDK5RAP3, CDK5 regulatory subunit-associated protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK5RAP3Q96JB5 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CDK5RAP3Q96JB5 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CDK5RAP3Q96JB5 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CDK5RAP3Q96JB5 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
CDK5RAP3Q96JB5 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CDK5RAP3Q96JB5 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CDK5RAP3Q96JB5 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CDK5RAP3Q96JB5 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CDK5RAP3Q96JB5 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CDK5RAP3Q96JB5 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CDK5RAP3Q96JB5 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CDK5RAP3Q96JB5 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
CDK5RAP3Q96JB5 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CDK5RAP3Q96JB5 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CDK5RAP3Q96JB5 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CDK5RAP3Q96JB5 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CDK5RAP3Q96JB5 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CDK5RAP3Q96JB5 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CDK5RAP3Q96JB5 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CDK5RAP3Q96JB5 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CDK5RAP3Q96JB5 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CDK5RAP3Q96JB5 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CDK5RAP3Q96JB5 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CDK5RAP3Q96JB5 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CDK5RAP3Q96JB5 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CDK5RAP3Q96JB5 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CDK5RAP3Q96JB5 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CDK5RAP3Q96JB5 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CDK5RAP3Q96JB5 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CDK5RAP3Q96JB5 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CDK5RAP3Q96JB5 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CDK5RAP3Q96JB5 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CDK5RAP3Q96JB5 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CDK5RAP3Q96JB5 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CDK5RAP3Q96JB5 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CDK5RAP3Q96JB5 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CDK5RAP3Q96JB5 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CDK5RAP3Q96JB5 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CDK5RAP3Q96JB5 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CDK5RAP3Q96JB5 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CDK5RAP3Q96JB5 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
CDK5RAP3Q96JB5 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CDK5RAP3Q96JB5 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
CDK5RAP3Q96JB5 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CDK5RAP3Q96JB5 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CDK5RAP3Q96JB5 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CDK5RAP3Q96JB5 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CDK5RAP3Q96JB5 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CDK5RAP3Q96JB5 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CDK5RAP3Q96JB5 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CDK5RAP3Q96JB5 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CDK5RAP3Q96JB5 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CDK5RAP3Q96JB5 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CDK5RAP3Q96JB5 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CDK5RAP3Q96JB5 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CDK5RAP3Q96JB5 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CDK5RAP3Q96JB5 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CDK5RAP3Q96JB5 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CDK5RAP3Q96JB5 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CDK5RAP3Q96JB5 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CDK5RAP3Q96JB5 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CDK5RAP3Q96JB5 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CDK5RAP3Q96JB5 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CDK5RAP3Q96JB5 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CDK5RAP3Q96JB5 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CDK5RAP3Q96JB5 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
CDK5RAP3Q96JB5 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
CDK5RAP3Q96JB5 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
CDK5RAP3Q96JB5 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CDK5RAP3Q96JB5 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CDK5RAP3Q96JB5 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CDK5RAP3Q96JB5 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CDK5RAP3Q96JB5 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
CDK5RAP3Q96JB5 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CDK5RAP3Q96JB5 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CDK5RAP3Q96JB5 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CDK5RAP3Q96JB5 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CDK5RAP3Q96JB5 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CDK5RAP3Q96JB5 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CDK5RAP3Q96JB5 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CDK5RAP3Q96JB5 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CDK5RAP3Q96JB5 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CDK5RAP3Q96JB5 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
CDK5RAP3Q96JB5 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CDK5RAP3Q96JB5 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CDK5RAP3Q96JB5 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CDK5RAP3Q96JB5 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CDK5RAP3Q96JB5 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CDK5RAP3Q96JB5 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CDK5RAP3Q96JB5 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CDK5RAP3Q96JB5 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CDK5RAP3Q96JB5 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CDK5RAP3Q96JB5 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CDK5RAP3Q96JB5 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CDK5RAP3Q96JB5 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CDK5RAP3Q96JB5 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CDK5RAP3Q96JB5 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CDK5RAP3Q96JB5 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CDK5RAP3Q96JB5 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CDK5RAP3Q96JB5 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.6 ms