Protein–RNA interactions for Protein: Q96EX2

RNFT2, RING finger and transmembrane domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNFT2Q96EX2 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RNFT2Q96EX2 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RNFT2Q96EX2 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RNFT2Q96EX2 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RNFT2Q96EX2 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RNFT2Q96EX2 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RNFT2Q96EX2 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RNFT2Q96EX2 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RNFT2Q96EX2 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RNFT2Q96EX2 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RNFT2Q96EX2 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RNFT2Q96EX2 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RNFT2Q96EX2 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RNFT2Q96EX2 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RNFT2Q96EX2 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RNFT2Q96EX2 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RNFT2Q96EX2 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RNFT2Q96EX2 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RNFT2Q96EX2 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RNFT2Q96EX2 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RNFT2Q96EX2 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RNFT2Q96EX2 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RNFT2Q96EX2 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RNFT2Q96EX2 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RNFT2Q96EX2 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RNFT2Q96EX2 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RNFT2Q96EX2 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RNFT2Q96EX2 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RNFT2Q96EX2 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
RNFT2Q96EX2 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RNFT2Q96EX2 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RNFT2Q96EX2 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
RNFT2Q96EX2 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RNFT2Q96EX2 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RNFT2Q96EX2 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RNFT2Q96EX2 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RNFT2Q96EX2 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RNFT2Q96EX2 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RNFT2Q96EX2 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
RNFT2Q96EX2 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RNFT2Q96EX2 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RNFT2Q96EX2 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RNFT2Q96EX2 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RNFT2Q96EX2 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RNFT2Q96EX2 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RNFT2Q96EX2 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RNFT2Q96EX2 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RNFT2Q96EX2 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RNFT2Q96EX2 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RNFT2Q96EX2 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RNFT2Q96EX2 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RNFT2Q96EX2 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RNFT2Q96EX2 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RNFT2Q96EX2 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RNFT2Q96EX2 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RNFT2Q96EX2 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RNFT2Q96EX2 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RNFT2Q96EX2 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RNFT2Q96EX2 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
RNFT2Q96EX2 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RNFT2Q96EX2 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RNFT2Q96EX2 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RNFT2Q96EX2 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
RNFT2Q96EX2 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RNFT2Q96EX2 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RNFT2Q96EX2 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RNFT2Q96EX2 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RNFT2Q96EX2 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RNFT2Q96EX2 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RNFT2Q96EX2 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RNFT2Q96EX2 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RNFT2Q96EX2 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RNFT2Q96EX2 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RNFT2Q96EX2 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RNFT2Q96EX2 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RNFT2Q96EX2 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RNFT2Q96EX2 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RNFT2Q96EX2 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RNFT2Q96EX2 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RNFT2Q96EX2 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
RNFT2Q96EX2 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
RNFT2Q96EX2 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RNFT2Q96EX2 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RNFT2Q96EX2 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
RNFT2Q96EX2 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RNFT2Q96EX2 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RNFT2Q96EX2 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RNFT2Q96EX2 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RNFT2Q96EX2 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RNFT2Q96EX2 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RNFT2Q96EX2 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
RNFT2Q96EX2 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RNFT2Q96EX2 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RNFT2Q96EX2 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RNFT2Q96EX2 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RNFT2Q96EX2 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RNFT2Q96EX2 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RNFT2Q96EX2 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RNFT2Q96EX2 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RNFT2Q96EX2 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.7 ms