Protein–RNA interactions for Protein: Q96ES7

SGF29, SAGA-associated factor 29, humanhuman

Predictions only

Length 293 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGF29Q96ES7 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SGF29Q96ES7 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SGF29Q96ES7 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SGF29Q96ES7 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SGF29Q96ES7 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SGF29Q96ES7 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SGF29Q96ES7 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SGF29Q96ES7 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SGF29Q96ES7 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SGF29Q96ES7 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SGF29Q96ES7 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SGF29Q96ES7 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SGF29Q96ES7 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SGF29Q96ES7 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SGF29Q96ES7 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
SGF29Q96ES7 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SGF29Q96ES7 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SGF29Q96ES7 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SGF29Q96ES7 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SGF29Q96ES7 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
SGF29Q96ES7 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SGF29Q96ES7 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SGF29Q96ES7 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SGF29Q96ES7 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
SGF29Q96ES7 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SGF29Q96ES7 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SGF29Q96ES7 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SGF29Q96ES7 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SGF29Q96ES7 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SGF29Q96ES7 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SGF29Q96ES7 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SGF29Q96ES7 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SGF29Q96ES7 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SGF29Q96ES7 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SGF29Q96ES7 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SGF29Q96ES7 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
SGF29Q96ES7 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SGF29Q96ES7 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SGF29Q96ES7 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
SGF29Q96ES7 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SGF29Q96ES7 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SGF29Q96ES7 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SGF29Q96ES7 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SGF29Q96ES7 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SGF29Q96ES7 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SGF29Q96ES7 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SGF29Q96ES7 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SGF29Q96ES7 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SGF29Q96ES7 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SGF29Q96ES7 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SGF29Q96ES7 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SGF29Q96ES7 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SGF29Q96ES7 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SGF29Q96ES7 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SGF29Q96ES7 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SGF29Q96ES7 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SGF29Q96ES7 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SGF29Q96ES7 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SGF29Q96ES7 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SGF29Q96ES7 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SGF29Q96ES7 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SGF29Q96ES7 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SGF29Q96ES7 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SGF29Q96ES7 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SGF29Q96ES7 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SGF29Q96ES7 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SGF29Q96ES7 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SGF29Q96ES7 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SGF29Q96ES7 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SGF29Q96ES7 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SGF29Q96ES7 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SGF29Q96ES7 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SGF29Q96ES7 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SGF29Q96ES7 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SGF29Q96ES7 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SGF29Q96ES7 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SGF29Q96ES7 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SGF29Q96ES7 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SGF29Q96ES7 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SGF29Q96ES7 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SGF29Q96ES7 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SGF29Q96ES7 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SGF29Q96ES7 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SGF29Q96ES7 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SGF29Q96ES7 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SGF29Q96ES7 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SGF29Q96ES7 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SGF29Q96ES7 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
SGF29Q96ES7 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SGF29Q96ES7 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
SGF29Q96ES7 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SGF29Q96ES7 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SGF29Q96ES7 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SGF29Q96ES7 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SGF29Q96ES7 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SGF29Q96ES7 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SGF29Q96ES7 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SGF29Q96ES7 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SGF29Q96ES7 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SGF29Q96ES7 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms