Protein–RNA interactions for Protein: Q96D59

RNF183, Probable E3 ubiquitin-protein ligase RNF183, humanhuman

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Length 192 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF183Q96D59 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
RNF183Q96D59 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
RNF183Q96D59 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
RNF183Q96D59 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
RNF183Q96D59 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
RNF183Q96D59 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
RNF183Q96D59 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
RNF183Q96D59 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
RNF183Q96D59 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
RNF183Q96D59 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
RNF183Q96D59 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
RNF183Q96D59 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
RNF183Q96D59 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
RNF183Q96D59 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
RNF183Q96D59 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
RNF183Q96D59 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
RNF183Q96D59 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
RNF183Q96D59 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC13.42□□□□□ -0.26
RNF183Q96D59 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
RNF183Q96D59 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
RNF183Q96D59 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
RNF183Q96D59 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
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RNF183Q96D59 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
RNF183Q96D59 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
RNF183Q96D59 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
RNF183Q96D59 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
RNF183Q96D59 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
RNF183Q96D59 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
RNF183Q96D59 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
RNF183Q96D59 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
RNF183Q96D59 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
RNF183Q96D59 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
RNF183Q96D59 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
RNF183Q96D59 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
RNF183Q96D59 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
RNF183Q96D59 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
RNF183Q96D59 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
RNF183Q96D59 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
RNF183Q96D59 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
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RNF183Q96D59 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
RNF183Q96D59 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
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RNF183Q96D59 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
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RNF183Q96D59 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
RNF183Q96D59 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
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RNF183Q96D59 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
RNF183Q96D59 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
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RNF183Q96D59 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
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RNF183Q96D59 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
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RNF183Q96D59 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
RNF183Q96D59 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
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RNF183Q96D59 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
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RNF183Q96D59 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
RNF183Q96D59 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
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RNF183Q96D59 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
RNF183Q96D59 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
RNF183Q96D59 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
RNF183Q96D59 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
RNF183Q96D59 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
RNF183Q96D59 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
RNF183Q96D59 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
RNF183Q96D59 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
RNF183Q96D59 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
RNF183Q96D59 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
RNF183Q96D59 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
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