Protein–RNA interactions for Protein: Q96C34

RUNDC1, RUN domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 613 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNDC1Q96C34 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
RUNDC1Q96C34 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
RUNDC1Q96C34 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
RUNDC1Q96C34 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
RUNDC1Q96C34 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
RUNDC1Q96C34 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
RUNDC1Q96C34 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
RUNDC1Q96C34 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
RUNDC1Q96C34 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
RUNDC1Q96C34 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
RUNDC1Q96C34 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
RUNDC1Q96C34 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
RUNDC1Q96C34 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
RUNDC1Q96C34 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
RUNDC1Q96C34 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
RUNDC1Q96C34 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
RUNDC1Q96C34 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
RUNDC1Q96C34 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
RUNDC1Q96C34 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
RUNDC1Q96C34 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
RUNDC1Q96C34 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
RUNDC1Q96C34 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
RUNDC1Q96C34 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
RUNDC1Q96C34 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
RUNDC1Q96C34 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
RUNDC1Q96C34 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
RUNDC1Q96C34 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
RUNDC1Q96C34 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
RUNDC1Q96C34 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
RUNDC1Q96C34 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
RUNDC1Q96C34 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
RUNDC1Q96C34 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
RUNDC1Q96C34 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.39
RUNDC1Q96C34 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.39
RUNDC1Q96C34 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
RUNDC1Q96C34 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
RUNDC1Q96C34 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
RUNDC1Q96C34 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
RUNDC1Q96C34 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
RUNDC1Q96C34 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
RUNDC1Q96C34 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
RUNDC1Q96C34 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
RUNDC1Q96C34 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
RUNDC1Q96C34 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
RUNDC1Q96C34 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
RUNDC1Q96C34 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
RUNDC1Q96C34 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
RUNDC1Q96C34 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
RUNDC1Q96C34 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
RUNDC1Q96C34 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
RUNDC1Q96C34 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
RUNDC1Q96C34 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
RUNDC1Q96C34 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
RUNDC1Q96C34 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
RUNDC1Q96C34 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
RUNDC1Q96C34 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
RUNDC1Q96C34 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
RUNDC1Q96C34 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
RUNDC1Q96C34 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
RUNDC1Q96C34 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
RUNDC1Q96C34 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
RUNDC1Q96C34 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
RUNDC1Q96C34 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RUNDC1Q96C34 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
RUNDC1Q96C34 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RUNDC1Q96C34 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
RUNDC1Q96C34 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RUNDC1Q96C34 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RUNDC1Q96C34 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RUNDC1Q96C34 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RUNDC1Q96C34 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
RUNDC1Q96C34 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
RUNDC1Q96C34 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
RUNDC1Q96C34 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
RUNDC1Q96C34 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RUNDC1Q96C34 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
RUNDC1Q96C34 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
RUNDC1Q96C34 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RUNDC1Q96C34 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC23.75■■□□□ 1.39
RUNDC1Q96C34 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC23.75■■□□□ 1.39
RUNDC1Q96C34 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RUNDC1Q96C34 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
RUNDC1Q96C34 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
RUNDC1Q96C34 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RUNDC1Q96C34 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
RUNDC1Q96C34 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RUNDC1Q96C34 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RUNDC1Q96C34 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
RUNDC1Q96C34 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
RUNDC1Q96C34 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
RUNDC1Q96C34 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
RUNDC1Q96C34 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
RUNDC1Q96C34 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
RUNDC1Q96C34 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
RUNDC1Q96C34 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
RUNDC1Q96C34 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
RUNDC1Q96C34 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
RUNDC1Q96C34 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
RUNDC1Q96C34 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
RUNDC1Q96C34 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms