Protein–RNA interactions for Protein: Q96BD6

SPSB1, SPRY domain-containing SOCS box protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPSB1Q96BD6 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SPSB1Q96BD6 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SPSB1Q96BD6 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SPSB1Q96BD6 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SPSB1Q96BD6 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SPSB1Q96BD6 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SPSB1Q96BD6 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SPSB1Q96BD6 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SPSB1Q96BD6 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
SPSB1Q96BD6 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SPSB1Q96BD6 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SPSB1Q96BD6 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SPSB1Q96BD6 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SPSB1Q96BD6 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SPSB1Q96BD6 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SPSB1Q96BD6 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
SPSB1Q96BD6 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SPSB1Q96BD6 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SPSB1Q96BD6 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SPSB1Q96BD6 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SPSB1Q96BD6 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SPSB1Q96BD6 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SPSB1Q96BD6 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SPSB1Q96BD6 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
SPSB1Q96BD6 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SPSB1Q96BD6 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SPSB1Q96BD6 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SPSB1Q96BD6 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SPSB1Q96BD6 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SPSB1Q96BD6 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SPSB1Q96BD6 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SPSB1Q96BD6 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SPSB1Q96BD6 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SPSB1Q96BD6 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SPSB1Q96BD6 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SPSB1Q96BD6 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SPSB1Q96BD6 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SPSB1Q96BD6 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SPSB1Q96BD6 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SPSB1Q96BD6 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SPSB1Q96BD6 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SPSB1Q96BD6 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SPSB1Q96BD6 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SPSB1Q96BD6 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SPSB1Q96BD6 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SPSB1Q96BD6 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SPSB1Q96BD6 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SPSB1Q96BD6 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SPSB1Q96BD6 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SPSB1Q96BD6 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SPSB1Q96BD6 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SPSB1Q96BD6 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SPSB1Q96BD6 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SPSB1Q96BD6 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SPSB1Q96BD6 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SPSB1Q96BD6 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SPSB1Q96BD6 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
SPSB1Q96BD6 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SPSB1Q96BD6 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SPSB1Q96BD6 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SPSB1Q96BD6 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SPSB1Q96BD6 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SPSB1Q96BD6 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SPSB1Q96BD6 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SPSB1Q96BD6 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
SPSB1Q96BD6 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SPSB1Q96BD6 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SPSB1Q96BD6 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SPSB1Q96BD6 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SPSB1Q96BD6 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SPSB1Q96BD6 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SPSB1Q96BD6 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SPSB1Q96BD6 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SPSB1Q96BD6 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SPSB1Q96BD6 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SPSB1Q96BD6 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SPSB1Q96BD6 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SPSB1Q96BD6 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SPSB1Q96BD6 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SPSB1Q96BD6 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SPSB1Q96BD6 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SPSB1Q96BD6 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SPSB1Q96BD6 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SPSB1Q96BD6 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SPSB1Q96BD6 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SPSB1Q96BD6 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SPSB1Q96BD6 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SPSB1Q96BD6 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SPSB1Q96BD6 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SPSB1Q96BD6 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SPSB1Q96BD6 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SPSB1Q96BD6 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SPSB1Q96BD6 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SPSB1Q96BD6 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SPSB1Q96BD6 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SPSB1Q96BD6 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SPSB1Q96BD6 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SPSB1Q96BD6 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SPSB1Q96BD6 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SPSB1Q96BD6 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms