Protein–RNA interactions for Protein: Q969G5

CAVIN3, Caveolae-associated protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAVIN3Q969G5 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
CAVIN3Q969G5 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
CAVIN3Q969G5 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CAVIN3Q969G5 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CAVIN3Q969G5 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CAVIN3Q969G5 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CAVIN3Q969G5 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CAVIN3Q969G5 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CAVIN3Q969G5 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CAVIN3Q969G5 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CAVIN3Q969G5 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CAVIN3Q969G5 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CAVIN3Q969G5 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CAVIN3Q969G5 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CAVIN3Q969G5 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CAVIN3Q969G5 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CAVIN3Q969G5 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CAVIN3Q969G5 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CAVIN3Q969G5 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CAVIN3Q969G5 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CAVIN3Q969G5 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CAVIN3Q969G5 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CAVIN3Q969G5 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CAVIN3Q969G5 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CAVIN3Q969G5 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CAVIN3Q969G5 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CAVIN3Q969G5 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CAVIN3Q969G5 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
CAVIN3Q969G5 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CAVIN3Q969G5 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CAVIN3Q969G5 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CAVIN3Q969G5 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CAVIN3Q969G5 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CAVIN3Q969G5 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CAVIN3Q969G5 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
CAVIN3Q969G5 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CAVIN3Q969G5 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CAVIN3Q969G5 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CAVIN3Q969G5 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CAVIN3Q969G5 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CAVIN3Q969G5 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CAVIN3Q969G5 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CAVIN3Q969G5 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CAVIN3Q969G5 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CAVIN3Q969G5 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CAVIN3Q969G5 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CAVIN3Q969G5 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CAVIN3Q969G5 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CAVIN3Q969G5 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CAVIN3Q969G5 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CAVIN3Q969G5 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CAVIN3Q969G5 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
CAVIN3Q969G5 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CAVIN3Q969G5 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CAVIN3Q969G5 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CAVIN3Q969G5 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CAVIN3Q969G5 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CAVIN3Q969G5 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CAVIN3Q969G5 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CAVIN3Q969G5 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
CAVIN3Q969G5 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CAVIN3Q969G5 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CAVIN3Q969G5 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CAVIN3Q969G5 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CAVIN3Q969G5 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CAVIN3Q969G5 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CAVIN3Q969G5 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CAVIN3Q969G5 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CAVIN3Q969G5 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CAVIN3Q969G5 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CAVIN3Q969G5 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CAVIN3Q969G5 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CAVIN3Q969G5 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CAVIN3Q969G5 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CAVIN3Q969G5 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CAVIN3Q969G5 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CAVIN3Q969G5 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
CAVIN3Q969G5 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CAVIN3Q969G5 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CAVIN3Q969G5 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CAVIN3Q969G5 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CAVIN3Q969G5 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CAVIN3Q969G5 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CAVIN3Q969G5 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CAVIN3Q969G5 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CAVIN3Q969G5 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CAVIN3Q969G5 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CAVIN3Q969G5 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CAVIN3Q969G5 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CAVIN3Q969G5 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
CAVIN3Q969G5 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CAVIN3Q969G5 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CAVIN3Q969G5 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CAVIN3Q969G5 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CAVIN3Q969G5 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CAVIN3Q969G5 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CAVIN3Q969G5 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CAVIN3Q969G5 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CAVIN3Q969G5 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
CAVIN3Q969G5 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.7 ms