Protein–RNA interactions for Protein: Q92879

CELF1, CUGBP Elav-like family member 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 486 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CELF1Q92879 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CELF1Q92879 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
CELF1Q92879 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CELF1Q92879 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
CELF1Q92879 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CELF1Q92879 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CELF1Q92879 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CELF1Q92879 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CELF1Q92879 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CELF1Q92879 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CELF1Q92879 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CELF1Q92879 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CELF1Q92879 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CELF1Q92879 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CELF1Q92879 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
CELF1Q92879 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CELF1Q92879 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CELF1Q92879 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CELF1Q92879 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CELF1Q92879 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CELF1Q92879 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CELF1Q92879 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CELF1Q92879 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CELF1Q92879 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CELF1Q92879 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CELF1Q92879 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CELF1Q92879 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CELF1Q92879 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CELF1Q92879 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CELF1Q92879 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CELF1Q92879 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CELF1Q92879 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CELF1Q92879 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CELF1Q92879 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CELF1Q92879 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CELF1Q92879 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CELF1Q92879 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CELF1Q92879 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CELF1Q92879 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CELF1Q92879 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CELF1Q92879 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CELF1Q92879 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CELF1Q92879 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CELF1Q92879 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CELF1Q92879 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CELF1Q92879 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CELF1Q92879 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CELF1Q92879 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CELF1Q92879 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CELF1Q92879 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CELF1Q92879 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CELF1Q92879 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CELF1Q92879 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CELF1Q92879 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CELF1Q92879 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CELF1Q92879 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CELF1Q92879 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CELF1Q92879 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CELF1Q92879 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CELF1Q92879 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CELF1Q92879 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CELF1Q92879 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CELF1Q92879 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CELF1Q92879 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CELF1Q92879 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CELF1Q92879 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CELF1Q92879 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CELF1Q92879 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CELF1Q92879 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CELF1Q92879 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CELF1Q92879 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CELF1Q92879 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CELF1Q92879 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CELF1Q92879 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CELF1Q92879 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CELF1Q92879 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CELF1Q92879 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CELF1Q92879 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CELF1Q92879 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CELF1Q92879 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CELF1Q92879 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CELF1Q92879 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CELF1Q92879 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CELF1Q92879 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CELF1Q92879 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CELF1Q92879 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CELF1Q92879 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CELF1Q92879 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CELF1Q92879 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CELF1Q92879 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CELF1Q92879 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CELF1Q92879 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CELF1Q92879 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CELF1Q92879 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CELF1Q92879 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
CELF1Q92879 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CELF1Q92879 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CELF1Q92879 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
CELF1Q92879 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CELF1Q92879 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.8 ms