Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFY4

SEMA6D, Semaphorin-6D, humanhuman

Predictions only

Length 1,073 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA6DQ8NFY4 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SEMA6DQ8NFY4 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SEMA6DQ8NFY4 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SEMA6DQ8NFY4 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SEMA6DQ8NFY4 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SEMA6DQ8NFY4 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SEMA6DQ8NFY4 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SEMA6DQ8NFY4 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SEMA6DQ8NFY4 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
SEMA6DQ8NFY4 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SEMA6DQ8NFY4 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SEMA6DQ8NFY4 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SEMA6DQ8NFY4 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SEMA6DQ8NFY4 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SEMA6DQ8NFY4 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SEMA6DQ8NFY4 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SEMA6DQ8NFY4 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SEMA6DQ8NFY4 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SEMA6DQ8NFY4 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SEMA6DQ8NFY4 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SEMA6DQ8NFY4 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SEMA6DQ8NFY4 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
SEMA6DQ8NFY4 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SEMA6DQ8NFY4 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SEMA6DQ8NFY4 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
SEMA6DQ8NFY4 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SEMA6DQ8NFY4 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SEMA6DQ8NFY4 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SEMA6DQ8NFY4 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SEMA6DQ8NFY4 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SEMA6DQ8NFY4 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SEMA6DQ8NFY4 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SEMA6DQ8NFY4 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SEMA6DQ8NFY4 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SEMA6DQ8NFY4 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SEMA6DQ8NFY4 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SEMA6DQ8NFY4 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SEMA6DQ8NFY4 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SEMA6DQ8NFY4 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SEMA6DQ8NFY4 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SEMA6DQ8NFY4 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SEMA6DQ8NFY4 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SEMA6DQ8NFY4 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SEMA6DQ8NFY4 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
SEMA6DQ8NFY4 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SEMA6DQ8NFY4 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
SEMA6DQ8NFY4 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.13
SEMA6DQ8NFY4 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
SEMA6DQ8NFY4 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
SEMA6DQ8NFY4 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
SEMA6DQ8NFY4 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
SEMA6DQ8NFY4 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC15.83■□□□□ 0.13
SEMA6DQ8NFY4 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
SEMA6DQ8NFY4 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
SEMA6DQ8NFY4 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SEMA6DQ8NFY4 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SEMA6DQ8NFY4 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SEMA6DQ8NFY4 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SEMA6DQ8NFY4 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SEMA6DQ8NFY4 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SEMA6DQ8NFY4 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SEMA6DQ8NFY4 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
SEMA6DQ8NFY4 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
SEMA6DQ8NFY4 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
SEMA6DQ8NFY4 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SEMA6DQ8NFY4 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SEMA6DQ8NFY4 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SEMA6DQ8NFY4 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SEMA6DQ8NFY4 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SEMA6DQ8NFY4 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SEMA6DQ8NFY4 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SEMA6DQ8NFY4 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SEMA6DQ8NFY4 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SEMA6DQ8NFY4 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
SEMA6DQ8NFY4 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SEMA6DQ8NFY4 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SEMA6DQ8NFY4 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SEMA6DQ8NFY4 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
SEMA6DQ8NFY4 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SEMA6DQ8NFY4 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SEMA6DQ8NFY4 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SEMA6DQ8NFY4 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SEMA6DQ8NFY4 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SEMA6DQ8NFY4 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SEMA6DQ8NFY4 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SEMA6DQ8NFY4 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SEMA6DQ8NFY4 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SEMA6DQ8NFY4 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SEMA6DQ8NFY4 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SEMA6DQ8NFY4 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SEMA6DQ8NFY4 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SEMA6DQ8NFY4 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SEMA6DQ8NFY4 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SEMA6DQ8NFY4 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SEMA6DQ8NFY4 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
SEMA6DQ8NFY4 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SEMA6DQ8NFY4 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SEMA6DQ8NFY4 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SEMA6DQ8NFY4 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SEMA6DQ8NFY4 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms