Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEJ9

NGDN, Neuroguidin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 315 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NGDNQ8NEJ9 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
NGDNQ8NEJ9 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
NGDNQ8NEJ9 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NGDNQ8NEJ9 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NGDNQ8NEJ9 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
NGDNQ8NEJ9 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NGDNQ8NEJ9 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NGDNQ8NEJ9 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NGDNQ8NEJ9 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
NGDNQ8NEJ9 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NGDNQ8NEJ9 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NGDNQ8NEJ9 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
NGDNQ8NEJ9 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NGDNQ8NEJ9 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NGDNQ8NEJ9 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NGDNQ8NEJ9 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NGDNQ8NEJ9 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
NGDNQ8NEJ9 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
NGDNQ8NEJ9 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
NGDNQ8NEJ9 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
NGDNQ8NEJ9 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NGDNQ8NEJ9 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
NGDNQ8NEJ9 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NGDNQ8NEJ9 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NGDNQ8NEJ9 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NGDNQ8NEJ9 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
NGDNQ8NEJ9 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
NGDNQ8NEJ9 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
NGDNQ8NEJ9 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
NGDNQ8NEJ9 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NGDNQ8NEJ9 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
NGDNQ8NEJ9 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NGDNQ8NEJ9 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NGDNQ8NEJ9 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
NGDNQ8NEJ9 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NGDNQ8NEJ9 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NGDNQ8NEJ9 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
NGDNQ8NEJ9 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
NGDNQ8NEJ9 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
NGDNQ8NEJ9 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
NGDNQ8NEJ9 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NGDNQ8NEJ9 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NGDNQ8NEJ9 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NGDNQ8NEJ9 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
NGDNQ8NEJ9 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NGDNQ8NEJ9 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
NGDNQ8NEJ9 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NGDNQ8NEJ9 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
NGDNQ8NEJ9 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
NGDNQ8NEJ9 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
NGDNQ8NEJ9 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NGDNQ8NEJ9 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NGDNQ8NEJ9 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
NGDNQ8NEJ9 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
NGDNQ8NEJ9 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
NGDNQ8NEJ9 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
NGDNQ8NEJ9 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
NGDNQ8NEJ9 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
NGDNQ8NEJ9 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
NGDNQ8NEJ9 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
NGDNQ8NEJ9 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
NGDNQ8NEJ9 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
NGDNQ8NEJ9 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
NGDNQ8NEJ9 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
NGDNQ8NEJ9 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
NGDNQ8NEJ9 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NGDNQ8NEJ9 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
NGDNQ8NEJ9 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NGDNQ8NEJ9 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
NGDNQ8NEJ9 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NGDNQ8NEJ9 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NGDNQ8NEJ9 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NGDNQ8NEJ9 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NGDNQ8NEJ9 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
NGDNQ8NEJ9 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
NGDNQ8NEJ9 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NGDNQ8NEJ9 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.53■■□□□ 1.52
NGDNQ8NEJ9 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
NGDNQ8NEJ9 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
NGDNQ8NEJ9 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
NGDNQ8NEJ9 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NGDNQ8NEJ9 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
NGDNQ8NEJ9 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NGDNQ8NEJ9 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NGDNQ8NEJ9 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
NGDNQ8NEJ9 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
NGDNQ8NEJ9 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
NGDNQ8NEJ9 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
NGDNQ8NEJ9 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NGDNQ8NEJ9 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NGDNQ8NEJ9 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NGDNQ8NEJ9 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
NGDNQ8NEJ9 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NGDNQ8NEJ9 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
NGDNQ8NEJ9 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NGDNQ8NEJ9 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NGDNQ8NEJ9 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NGDNQ8NEJ9 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
NGDNQ8NEJ9 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
NGDNQ8NEJ9 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms