Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9I0

SYT2, Synaptotagmin-2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 419 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYT2Q8N9I0 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SYT2Q8N9I0 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SYT2Q8N9I0 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SYT2Q8N9I0 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SYT2Q8N9I0 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SYT2Q8N9I0 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
SYT2Q8N9I0 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SYT2Q8N9I0 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SYT2Q8N9I0 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SYT2Q8N9I0 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SYT2Q8N9I0 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SYT2Q8N9I0 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SYT2Q8N9I0 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SYT2Q8N9I0 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SYT2Q8N9I0 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SYT2Q8N9I0 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SYT2Q8N9I0 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SYT2Q8N9I0 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SYT2Q8N9I0 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SYT2Q8N9I0 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SYT2Q8N9I0 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SYT2Q8N9I0 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SYT2Q8N9I0 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SYT2Q8N9I0 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SYT2Q8N9I0 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SYT2Q8N9I0 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SYT2Q8N9I0 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SYT2Q8N9I0 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SYT2Q8N9I0 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SYT2Q8N9I0 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SYT2Q8N9I0 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SYT2Q8N9I0 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SYT2Q8N9I0 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SYT2Q8N9I0 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
SYT2Q8N9I0 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SYT2Q8N9I0 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SYT2Q8N9I0 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SYT2Q8N9I0 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SYT2Q8N9I0 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SYT2Q8N9I0 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
SYT2Q8N9I0 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SYT2Q8N9I0 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
SYT2Q8N9I0 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SYT2Q8N9I0 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SYT2Q8N9I0 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SYT2Q8N9I0 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SYT2Q8N9I0 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SYT2Q8N9I0 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SYT2Q8N9I0 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SYT2Q8N9I0 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SYT2Q8N9I0 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SYT2Q8N9I0 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SYT2Q8N9I0 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SYT2Q8N9I0 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SYT2Q8N9I0 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SYT2Q8N9I0 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SYT2Q8N9I0 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SYT2Q8N9I0 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SYT2Q8N9I0 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SYT2Q8N9I0 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SYT2Q8N9I0 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SYT2Q8N9I0 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SYT2Q8N9I0 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SYT2Q8N9I0 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SYT2Q8N9I0 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SYT2Q8N9I0 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SYT2Q8N9I0 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SYT2Q8N9I0 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
SYT2Q8N9I0 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SYT2Q8N9I0 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SYT2Q8N9I0 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SYT2Q8N9I0 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SYT2Q8N9I0 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
SYT2Q8N9I0 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SYT2Q8N9I0 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SYT2Q8N9I0 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SYT2Q8N9I0 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
SYT2Q8N9I0 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SYT2Q8N9I0 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SYT2Q8N9I0 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
SYT2Q8N9I0 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SYT2Q8N9I0 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SYT2Q8N9I0 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SYT2Q8N9I0 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SYT2Q8N9I0 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SYT2Q8N9I0 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
SYT2Q8N9I0 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SYT2Q8N9I0 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SYT2Q8N9I0 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SYT2Q8N9I0 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SYT2Q8N9I0 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
SYT2Q8N9I0 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SYT2Q8N9I0 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SYT2Q8N9I0 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SYT2Q8N9I0 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SYT2Q8N9I0 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SYT2Q8N9I0 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SYT2Q8N9I0 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SYT2Q8N9I0 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SYT2Q8N9I0 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.5 ms