Protein–RNA interactions for Protein: Q8N815

CNTD1, Cyclin N-terminal domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTD1Q8N815 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CNTD1Q8N815 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CNTD1Q8N815 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CNTD1Q8N815 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CNTD1Q8N815 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
CNTD1Q8N815 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
CNTD1Q8N815 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CNTD1Q8N815 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CNTD1Q8N815 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CNTD1Q8N815 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CNTD1Q8N815 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CNTD1Q8N815 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CNTD1Q8N815 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CNTD1Q8N815 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CNTD1Q8N815 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CNTD1Q8N815 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CNTD1Q8N815 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CNTD1Q8N815 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CNTD1Q8N815 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CNTD1Q8N815 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CNTD1Q8N815 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CNTD1Q8N815 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CNTD1Q8N815 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CNTD1Q8N815 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
CNTD1Q8N815 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CNTD1Q8N815 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CNTD1Q8N815 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CNTD1Q8N815 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CNTD1Q8N815 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CNTD1Q8N815 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CNTD1Q8N815 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
CNTD1Q8N815 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CNTD1Q8N815 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CNTD1Q8N815 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CNTD1Q8N815 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CNTD1Q8N815 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CNTD1Q8N815 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CNTD1Q8N815 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CNTD1Q8N815 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CNTD1Q8N815 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CNTD1Q8N815 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CNTD1Q8N815 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CNTD1Q8N815 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CNTD1Q8N815 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CNTD1Q8N815 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CNTD1Q8N815 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CNTD1Q8N815 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CNTD1Q8N815 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CNTD1Q8N815 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CNTD1Q8N815 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CNTD1Q8N815 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CNTD1Q8N815 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CNTD1Q8N815 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CNTD1Q8N815 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
CNTD1Q8N815 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CNTD1Q8N815 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CNTD1Q8N815 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CNTD1Q8N815 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CNTD1Q8N815 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CNTD1Q8N815 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CNTD1Q8N815 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CNTD1Q8N815 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CNTD1Q8N815 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CNTD1Q8N815 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CNTD1Q8N815 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CNTD1Q8N815 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CNTD1Q8N815 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CNTD1Q8N815 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CNTD1Q8N815 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CNTD1Q8N815 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CNTD1Q8N815 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CNTD1Q8N815 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CNTD1Q8N815 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CNTD1Q8N815 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CNTD1Q8N815 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CNTD1Q8N815 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CNTD1Q8N815 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CNTD1Q8N815 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CNTD1Q8N815 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CNTD1Q8N815 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CNTD1Q8N815 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CNTD1Q8N815 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CNTD1Q8N815 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CNTD1Q8N815 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CNTD1Q8N815 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CNTD1Q8N815 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CNTD1Q8N815 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CNTD1Q8N815 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CNTD1Q8N815 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CNTD1Q8N815 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
CNTD1Q8N815 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CNTD1Q8N815 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CNTD1Q8N815 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CNTD1Q8N815 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CNTD1Q8N815 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CNTD1Q8N815 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CNTD1Q8N815 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CNTD1Q8N815 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CNTD1Q8N815 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CNTD1Q8N815 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms