Protein–RNA interactions for Protein: Q8N474

SFRP1, Secreted frizzled-related protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFRP1Q8N474 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SFRP1Q8N474 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
SFRP1Q8N474 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SFRP1Q8N474 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SFRP1Q8N474 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SFRP1Q8N474 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.47
SFRP1Q8N474 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
SFRP1Q8N474 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SFRP1Q8N474 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SFRP1Q8N474 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SFRP1Q8N474 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SFRP1Q8N474 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SFRP1Q8N474 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SFRP1Q8N474 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SFRP1Q8N474 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SFRP1Q8N474 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SFRP1Q8N474 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SFRP1Q8N474 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SFRP1Q8N474 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SFRP1Q8N474 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SFRP1Q8N474 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SFRP1Q8N474 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
SFRP1Q8N474 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SFRP1Q8N474 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SFRP1Q8N474 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SFRP1Q8N474 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SFRP1Q8N474 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SFRP1Q8N474 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SFRP1Q8N474 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SFRP1Q8N474 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SFRP1Q8N474 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SFRP1Q8N474 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SFRP1Q8N474 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SFRP1Q8N474 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SFRP1Q8N474 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SFRP1Q8N474 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SFRP1Q8N474 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SFRP1Q8N474 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SFRP1Q8N474 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SFRP1Q8N474 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SFRP1Q8N474 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SFRP1Q8N474 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SFRP1Q8N474 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SFRP1Q8N474 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SFRP1Q8N474 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SFRP1Q8N474 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SFRP1Q8N474 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SFRP1Q8N474 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SFRP1Q8N474 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SFRP1Q8N474 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SFRP1Q8N474 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SFRP1Q8N474 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC18■□□□□ 0.47
SFRP1Q8N474 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SFRP1Q8N474 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SFRP1Q8N474 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SFRP1Q8N474 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SFRP1Q8N474 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SFRP1Q8N474 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SFRP1Q8N474 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SFRP1Q8N474 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SFRP1Q8N474 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC18■□□□□ 0.47
SFRP1Q8N474 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC18■□□□□ 0.47
SFRP1Q8N474 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SFRP1Q8N474 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SFRP1Q8N474 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC18■□□□□ 0.47
SFRP1Q8N474 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SFRP1Q8N474 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SFRP1Q8N474 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SFRP1Q8N474 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SFRP1Q8N474 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SFRP1Q8N474 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SFRP1Q8N474 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SFRP1Q8N474 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SFRP1Q8N474 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC18■□□□□ 0.47
SFRP1Q8N474 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SFRP1Q8N474 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SFRP1Q8N474 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SFRP1Q8N474 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SFRP1Q8N474 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SFRP1Q8N474 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SFRP1Q8N474 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SFRP1Q8N474 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SFRP1Q8N474 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SFRP1Q8N474 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SFRP1Q8N474 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SFRP1Q8N474 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SFRP1Q8N474 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SFRP1Q8N474 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SFRP1Q8N474 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SFRP1Q8N474 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SFRP1Q8N474 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SFRP1Q8N474 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SFRP1Q8N474 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SFRP1Q8N474 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SFRP1Q8N474 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SFRP1Q8N474 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
SFRP1Q8N474 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SFRP1Q8N474 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SFRP1Q8N474 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SFRP1Q8N474 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms