Protein–RNA interactions for Protein: Q8IW40

CCDC103, Coiled-coil domain-containing protein 103, humanhuman

Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC103Q8IW40 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CCDC103Q8IW40 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
CCDC103Q8IW40 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CCDC103Q8IW40 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
CCDC103Q8IW40 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
CCDC103Q8IW40 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CCDC103Q8IW40 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC103Q8IW40 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC103Q8IW40 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC103Q8IW40 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC103Q8IW40 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC103Q8IW40 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC103Q8IW40 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC103Q8IW40 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC103Q8IW40 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC103Q8IW40 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC103Q8IW40 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC103Q8IW40 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC103Q8IW40 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC103Q8IW40 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC103Q8IW40 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC103Q8IW40 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC103Q8IW40 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC103Q8IW40 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC103Q8IW40 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC103Q8IW40 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC103Q8IW40 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC103Q8IW40 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC103Q8IW40 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC103Q8IW40 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC103Q8IW40 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC103Q8IW40 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC103Q8IW40 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC103Q8IW40 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC103Q8IW40 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC103Q8IW40 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC103Q8IW40 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC103Q8IW40 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC103Q8IW40 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC103Q8IW40 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC103Q8IW40 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC103Q8IW40 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC103Q8IW40 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC103Q8IW40 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC103Q8IW40 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC103Q8IW40 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC103Q8IW40 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC103Q8IW40 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC103Q8IW40 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC103Q8IW40 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC103Q8IW40 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC103Q8IW40 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC103Q8IW40 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC103Q8IW40 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC103Q8IW40 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC103Q8IW40 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC17■□□□□ 0.31
CCDC103Q8IW40 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC103Q8IW40 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC103Q8IW40 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC103Q8IW40 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC103Q8IW40 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC103Q8IW40 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC103Q8IW40 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC103Q8IW40 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC103Q8IW40 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC103Q8IW40 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC103Q8IW40 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC103Q8IW40 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC103Q8IW40 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC103Q8IW40 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC103Q8IW40 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC103Q8IW40 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC103Q8IW40 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC103Q8IW40 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC103Q8IW40 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC103Q8IW40 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC103Q8IW40 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC103Q8IW40 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC103Q8IW40 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC103Q8IW40 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC103Q8IW40 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC103Q8IW40 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC103Q8IW40 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC103Q8IW40 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC103Q8IW40 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC103Q8IW40 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC103Q8IW40 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC103Q8IW40 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC103Q8IW40 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC103Q8IW40 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC103Q8IW40 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC103Q8IW40 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC103Q8IW40 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC103Q8IW40 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC103Q8IW40 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC103Q8IW40 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC103Q8IW40 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC103Q8IW40 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC103Q8IW40 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC103Q8IW40 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms