Protein–RNA interactions for Protein: Q8IV08

PLD3, Phospholipase D3, humanhuman

Predictions only

Length 490 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLD3Q8IV08 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
PLD3Q8IV08 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PLD3Q8IV08 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PLD3Q8IV08 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PLD3Q8IV08 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PLD3Q8IV08 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PLD3Q8IV08 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PLD3Q8IV08 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PLD3Q8IV08 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PLD3Q8IV08 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PLD3Q8IV08 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PLD3Q8IV08 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PLD3Q8IV08 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PLD3Q8IV08 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PLD3Q8IV08 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PLD3Q8IV08 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PLD3Q8IV08 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PLD3Q8IV08 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PLD3Q8IV08 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PLD3Q8IV08 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PLD3Q8IV08 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PLD3Q8IV08 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PLD3Q8IV08 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PLD3Q8IV08 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
PLD3Q8IV08 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PLD3Q8IV08 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PLD3Q8IV08 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PLD3Q8IV08 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PLD3Q8IV08 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PLD3Q8IV08 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PLD3Q8IV08 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PLD3Q8IV08 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PLD3Q8IV08 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PLD3Q8IV08 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PLD3Q8IV08 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PLD3Q8IV08 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PLD3Q8IV08 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PLD3Q8IV08 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PLD3Q8IV08 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PLD3Q8IV08 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PLD3Q8IV08 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PLD3Q8IV08 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PLD3Q8IV08 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PLD3Q8IV08 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PLD3Q8IV08 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PLD3Q8IV08 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PLD3Q8IV08 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PLD3Q8IV08 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PLD3Q8IV08 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PLD3Q8IV08 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PLD3Q8IV08 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PLD3Q8IV08 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PLD3Q8IV08 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PLD3Q8IV08 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PLD3Q8IV08 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PLD3Q8IV08 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PLD3Q8IV08 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
PLD3Q8IV08 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PLD3Q8IV08 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PLD3Q8IV08 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PLD3Q8IV08 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PLD3Q8IV08 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PLD3Q8IV08 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PLD3Q8IV08 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PLD3Q8IV08 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PLD3Q8IV08 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PLD3Q8IV08 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PLD3Q8IV08 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PLD3Q8IV08 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PLD3Q8IV08 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PLD3Q8IV08 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PLD3Q8IV08 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
PLD3Q8IV08 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
PLD3Q8IV08 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
PLD3Q8IV08 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
PLD3Q8IV08 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PLD3Q8IV08 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
PLD3Q8IV08 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
PLD3Q8IV08 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
PLD3Q8IV08 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PLD3Q8IV08 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
PLD3Q8IV08 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PLD3Q8IV08 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PLD3Q8IV08 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
PLD3Q8IV08 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
PLD3Q8IV08 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
PLD3Q8IV08 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
PLD3Q8IV08 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
PLD3Q8IV08 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PLD3Q8IV08 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PLD3Q8IV08 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PLD3Q8IV08 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PLD3Q8IV08 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PLD3Q8IV08 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PLD3Q8IV08 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
PLD3Q8IV08 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
PLD3Q8IV08 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
PLD3Q8IV08 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PLD3Q8IV08 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
PLD3Q8IV08 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.9 ms