Protein–RNA interactions for Protein: Q86W92

PPFIBP1, Liprin-beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,011 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPFIBP1Q86W92 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
PPFIBP1Q86W92 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PPFIBP1Q86W92 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PPFIBP1Q86W92 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PPFIBP1Q86W92 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PPFIBP1Q86W92 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PPFIBP1Q86W92 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PPFIBP1Q86W92 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PPFIBP1Q86W92 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PPFIBP1Q86W92 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PPFIBP1Q86W92 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PPFIBP1Q86W92 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PPFIBP1Q86W92 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PPFIBP1Q86W92 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PPFIBP1Q86W92 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PPFIBP1Q86W92 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PPFIBP1Q86W92 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PPFIBP1Q86W92 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PPFIBP1Q86W92 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PPFIBP1Q86W92 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PPFIBP1Q86W92 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PPFIBP1Q86W92 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PPFIBP1Q86W92 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PPFIBP1Q86W92 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PPFIBP1Q86W92 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PPFIBP1Q86W92 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PPFIBP1Q86W92 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
PPFIBP1Q86W92 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PPFIBP1Q86W92 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
PPFIBP1Q86W92 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PPFIBP1Q86W92 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PPFIBP1Q86W92 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PPFIBP1Q86W92 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PPFIBP1Q86W92 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PPFIBP1Q86W92 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PPFIBP1Q86W92 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PPFIBP1Q86W92 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PPFIBP1Q86W92 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PPFIBP1Q86W92 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PPFIBP1Q86W92 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PPFIBP1Q86W92 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PPFIBP1Q86W92 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PPFIBP1Q86W92 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PPFIBP1Q86W92 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PPFIBP1Q86W92 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PPFIBP1Q86W92 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PPFIBP1Q86W92 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PPFIBP1Q86W92 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PPFIBP1Q86W92 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PPFIBP1Q86W92 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PPFIBP1Q86W92 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
PPFIBP1Q86W92 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PPFIBP1Q86W92 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PPFIBP1Q86W92 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PPFIBP1Q86W92 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PPFIBP1Q86W92 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PPFIBP1Q86W92 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PPFIBP1Q86W92 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PPFIBP1Q86W92 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PPFIBP1Q86W92 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PPFIBP1Q86W92 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PPFIBP1Q86W92 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PPFIBP1Q86W92 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PPFIBP1Q86W92 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PPFIBP1Q86W92 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PPFIBP1Q86W92 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
PPFIBP1Q86W92 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PPFIBP1Q86W92 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PPFIBP1Q86W92 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PPFIBP1Q86W92 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PPFIBP1Q86W92 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PPFIBP1Q86W92 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PPFIBP1Q86W92 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PPFIBP1Q86W92 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PPFIBP1Q86W92 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PPFIBP1Q86W92 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PPFIBP1Q86W92 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PPFIBP1Q86W92 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PPFIBP1Q86W92 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PPFIBP1Q86W92 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PPFIBP1Q86W92 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PPFIBP1Q86W92 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PPFIBP1Q86W92 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PPFIBP1Q86W92 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PPFIBP1Q86W92 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PPFIBP1Q86W92 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PPFIBP1Q86W92 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
PPFIBP1Q86W92 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PPFIBP1Q86W92 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PPFIBP1Q86W92 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
PPFIBP1Q86W92 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PPFIBP1Q86W92 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PPFIBP1Q86W92 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PPFIBP1Q86W92 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PPFIBP1Q86W92 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PPFIBP1Q86W92 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PPFIBP1Q86W92 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PPFIBP1Q86W92 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PPFIBP1Q86W92 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PPFIBP1Q86W92 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms