Protein–RNA interactions for Protein: Q76I76

SSH2, Protein phosphatase Slingshot homolog 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,423 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSH2Q76I76 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SSH2Q76I76 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SSH2Q76I76 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SSH2Q76I76 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SSH2Q76I76 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SSH2Q76I76 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
SSH2Q76I76 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
SSH2Q76I76 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SSH2Q76I76 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SSH2Q76I76 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SSH2Q76I76 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SSH2Q76I76 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SSH2Q76I76 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SSH2Q76I76 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
SSH2Q76I76 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SSH2Q76I76 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SSH2Q76I76 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SSH2Q76I76 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SSH2Q76I76 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SSH2Q76I76 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
SSH2Q76I76 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SSH2Q76I76 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SSH2Q76I76 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
SSH2Q76I76 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
SSH2Q76I76 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SSH2Q76I76 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SSH2Q76I76 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SSH2Q76I76 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SSH2Q76I76 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
SSH2Q76I76 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SSH2Q76I76 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SSH2Q76I76 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SSH2Q76I76 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SSH2Q76I76 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SSH2Q76I76 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SSH2Q76I76 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SSH2Q76I76 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SSH2Q76I76 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SSH2Q76I76 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SSH2Q76I76 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
SSH2Q76I76 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
SSH2Q76I76 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SSH2Q76I76 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SSH2Q76I76 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SSH2Q76I76 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SSH2Q76I76 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SSH2Q76I76 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SSH2Q76I76 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SSH2Q76I76 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SSH2Q76I76 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SSH2Q76I76 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
SSH2Q76I76 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
SSH2Q76I76 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
SSH2Q76I76 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SSH2Q76I76 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SSH2Q76I76 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SSH2Q76I76 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SSH2Q76I76 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SSH2Q76I76 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SSH2Q76I76 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SSH2Q76I76 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SSH2Q76I76 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SSH2Q76I76 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SSH2Q76I76 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SSH2Q76I76 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SSH2Q76I76 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SSH2Q76I76 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SSH2Q76I76 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SSH2Q76I76 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SSH2Q76I76 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SSH2Q76I76 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SSH2Q76I76 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
SSH2Q76I76 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SSH2Q76I76 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SSH2Q76I76 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SSH2Q76I76 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SSH2Q76I76 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SSH2Q76I76 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SSH2Q76I76 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
SSH2Q76I76 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SSH2Q76I76 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SSH2Q76I76 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SSH2Q76I76 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SSH2Q76I76 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SSH2Q76I76 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SSH2Q76I76 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
SSH2Q76I76 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SSH2Q76I76 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
SSH2Q76I76 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SSH2Q76I76 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SSH2Q76I76 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SSH2Q76I76 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SSH2Q76I76 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SSH2Q76I76 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SSH2Q76I76 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SSH2Q76I76 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SSH2Q76I76 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SSH2Q76I76 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SSH2Q76I76 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SSH2Q76I76 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms