Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZRI6

C15orf39, Uncharacterized protein C15orf39, humanhuman

Predictions only

Length 1,047 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C15orf39Q6ZRI6 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
C15orf39Q6ZRI6 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
C15orf39Q6ZRI6 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
C15orf39Q6ZRI6 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
C15orf39Q6ZRI6 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
C15orf39Q6ZRI6 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
C15orf39Q6ZRI6 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
C15orf39Q6ZRI6 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
C15orf39Q6ZRI6 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
C15orf39Q6ZRI6 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
C15orf39Q6ZRI6 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
C15orf39Q6ZRI6 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
C15orf39Q6ZRI6 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
C15orf39Q6ZRI6 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
C15orf39Q6ZRI6 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
C15orf39Q6ZRI6 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
C15orf39Q6ZRI6 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
C15orf39Q6ZRI6 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
C15orf39Q6ZRI6 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
C15orf39Q6ZRI6 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
C15orf39Q6ZRI6 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.55■□□□□ 0.72
C15orf39Q6ZRI6 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
C15orf39Q6ZRI6 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
C15orf39Q6ZRI6 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
C15orf39Q6ZRI6 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
C15orf39Q6ZRI6 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
C15orf39Q6ZRI6 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
C15orf39Q6ZRI6 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
C15orf39Q6ZRI6 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
C15orf39Q6ZRI6 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
C15orf39Q6ZRI6 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
C15orf39Q6ZRI6 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
C15orf39Q6ZRI6 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
C15orf39Q6ZRI6 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
C15orf39Q6ZRI6 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
C15orf39Q6ZRI6 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
C15orf39Q6ZRI6 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
C15orf39Q6ZRI6 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
C15orf39Q6ZRI6 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
C15orf39Q6ZRI6 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
C15orf39Q6ZRI6 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
C15orf39Q6ZRI6 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
C15orf39Q6ZRI6 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
C15orf39Q6ZRI6 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
C15orf39Q6ZRI6 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
C15orf39Q6ZRI6 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
C15orf39Q6ZRI6 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
C15orf39Q6ZRI6 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
C15orf39Q6ZRI6 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
C15orf39Q6ZRI6 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
C15orf39Q6ZRI6 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
C15orf39Q6ZRI6 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
C15orf39Q6ZRI6 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC19.54■□□□□ 0.72
C15orf39Q6ZRI6 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
C15orf39Q6ZRI6 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
C15orf39Q6ZRI6 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
C15orf39Q6ZRI6 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
C15orf39Q6ZRI6 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
C15orf39Q6ZRI6 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
C15orf39Q6ZRI6 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
C15orf39Q6ZRI6 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
C15orf39Q6ZRI6 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
C15orf39Q6ZRI6 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
C15orf39Q6ZRI6 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
C15orf39Q6ZRI6 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
C15orf39Q6ZRI6 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
C15orf39Q6ZRI6 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
C15orf39Q6ZRI6 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
C15orf39Q6ZRI6 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
C15orf39Q6ZRI6 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
C15orf39Q6ZRI6 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
C15orf39Q6ZRI6 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
C15orf39Q6ZRI6 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
C15orf39Q6ZRI6 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
C15orf39Q6ZRI6 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
C15orf39Q6ZRI6 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
C15orf39Q6ZRI6 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
C15orf39Q6ZRI6 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
C15orf39Q6ZRI6 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
C15orf39Q6ZRI6 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
C15orf39Q6ZRI6 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
C15orf39Q6ZRI6 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
C15orf39Q6ZRI6 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
C15orf39Q6ZRI6 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
C15orf39Q6ZRI6 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
C15orf39Q6ZRI6 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
C15orf39Q6ZRI6 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
C15orf39Q6ZRI6 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
C15orf39Q6ZRI6 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
C15orf39Q6ZRI6 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
C15orf39Q6ZRI6 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
C15orf39Q6ZRI6 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
C15orf39Q6ZRI6 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
C15orf39Q6ZRI6 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
C15orf39Q6ZRI6 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
C15orf39Q6ZRI6 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
C15orf39Q6ZRI6 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
C15orf39Q6ZRI6 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
C15orf39Q6ZRI6 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
C15orf39Q6ZRI6 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms