Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQX7

LIAT1, Protein LIAT1, humanhuman

Predictions only

Length 453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIAT1Q6ZQX7 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
LIAT1Q6ZQX7 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
LIAT1Q6ZQX7 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LIAT1Q6ZQX7 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LIAT1Q6ZQX7 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
LIAT1Q6ZQX7 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
LIAT1Q6ZQX7 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LIAT1Q6ZQX7 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
LIAT1Q6ZQX7 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
LIAT1Q6ZQX7 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
LIAT1Q6ZQX7 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
LIAT1Q6ZQX7 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LIAT1Q6ZQX7 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
LIAT1Q6ZQX7 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
LIAT1Q6ZQX7 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
LIAT1Q6ZQX7 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
LIAT1Q6ZQX7 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
LIAT1Q6ZQX7 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
LIAT1Q6ZQX7 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
LIAT1Q6ZQX7 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LIAT1Q6ZQX7 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
LIAT1Q6ZQX7 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LIAT1Q6ZQX7 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LIAT1Q6ZQX7 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LIAT1Q6ZQX7 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LIAT1Q6ZQX7 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LIAT1Q6ZQX7 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LIAT1Q6ZQX7 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LIAT1Q6ZQX7 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LIAT1Q6ZQX7 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LIAT1Q6ZQX7 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LIAT1Q6ZQX7 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LIAT1Q6ZQX7 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LIAT1Q6ZQX7 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LIAT1Q6ZQX7 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LIAT1Q6ZQX7 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LIAT1Q6ZQX7 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LIAT1Q6ZQX7 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LIAT1Q6ZQX7 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LIAT1Q6ZQX7 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
LIAT1Q6ZQX7 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LIAT1Q6ZQX7 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LIAT1Q6ZQX7 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LIAT1Q6ZQX7 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LIAT1Q6ZQX7 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LIAT1Q6ZQX7 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LIAT1Q6ZQX7 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LIAT1Q6ZQX7 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LIAT1Q6ZQX7 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LIAT1Q6ZQX7 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LIAT1Q6ZQX7 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LIAT1Q6ZQX7 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LIAT1Q6ZQX7 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LIAT1Q6ZQX7 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LIAT1Q6ZQX7 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LIAT1Q6ZQX7 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
LIAT1Q6ZQX7 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LIAT1Q6ZQX7 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LIAT1Q6ZQX7 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LIAT1Q6ZQX7 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LIAT1Q6ZQX7 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LIAT1Q6ZQX7 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LIAT1Q6ZQX7 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
LIAT1Q6ZQX7 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
LIAT1Q6ZQX7 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
LIAT1Q6ZQX7 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
LIAT1Q6ZQX7 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LIAT1Q6ZQX7 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
LIAT1Q6ZQX7 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LIAT1Q6ZQX7 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LIAT1Q6ZQX7 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LIAT1Q6ZQX7 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LIAT1Q6ZQX7 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LIAT1Q6ZQX7 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LIAT1Q6ZQX7 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LIAT1Q6ZQX7 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
LIAT1Q6ZQX7 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
LIAT1Q6ZQX7 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
LIAT1Q6ZQX7 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
LIAT1Q6ZQX7 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
LIAT1Q6ZQX7 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
LIAT1Q6ZQX7 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
LIAT1Q6ZQX7 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
LIAT1Q6ZQX7 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
LIAT1Q6ZQX7 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LIAT1Q6ZQX7 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LIAT1Q6ZQX7 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
LIAT1Q6ZQX7 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
LIAT1Q6ZQX7 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LIAT1Q6ZQX7 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LIAT1Q6ZQX7 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
LIAT1Q6ZQX7 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
LIAT1Q6ZQX7 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
LIAT1Q6ZQX7 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
LIAT1Q6ZQX7 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
LIAT1Q6ZQX7 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
LIAT1Q6ZQX7 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
LIAT1Q6ZQX7 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
LIAT1Q6ZQX7 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
LIAT1Q6ZQX7 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.8 ms