Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZMU5

TRIM72, Tripartite motif-containing protein 72, humanhuman

Predictions only

Length 477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM72Q6ZMU5 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TRIM72Q6ZMU5 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TRIM72Q6ZMU5 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TRIM72Q6ZMU5 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TRIM72Q6ZMU5 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TRIM72Q6ZMU5 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TRIM72Q6ZMU5 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TRIM72Q6ZMU5 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TRIM72Q6ZMU5 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TRIM72Q6ZMU5 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TRIM72Q6ZMU5 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TRIM72Q6ZMU5 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TRIM72Q6ZMU5 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TRIM72Q6ZMU5 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TRIM72Q6ZMU5 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TRIM72Q6ZMU5 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TRIM72Q6ZMU5 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TRIM72Q6ZMU5 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
TRIM72Q6ZMU5 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TRIM72Q6ZMU5 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
TRIM72Q6ZMU5 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TRIM72Q6ZMU5 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TRIM72Q6ZMU5 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TRIM72Q6ZMU5 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TRIM72Q6ZMU5 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TRIM72Q6ZMU5 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TRIM72Q6ZMU5 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TRIM72Q6ZMU5 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TRIM72Q6ZMU5 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TRIM72Q6ZMU5 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TRIM72Q6ZMU5 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TRIM72Q6ZMU5 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TRIM72Q6ZMU5 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TRIM72Q6ZMU5 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TRIM72Q6ZMU5 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TRIM72Q6ZMU5 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TRIM72Q6ZMU5 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TRIM72Q6ZMU5 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TRIM72Q6ZMU5 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TRIM72Q6ZMU5 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TRIM72Q6ZMU5 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
TRIM72Q6ZMU5 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
TRIM72Q6ZMU5 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TRIM72Q6ZMU5 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TRIM72Q6ZMU5 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TRIM72Q6ZMU5 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
TRIM72Q6ZMU5 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TRIM72Q6ZMU5 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TRIM72Q6ZMU5 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TRIM72Q6ZMU5 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TRIM72Q6ZMU5 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TRIM72Q6ZMU5 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TRIM72Q6ZMU5 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TRIM72Q6ZMU5 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TRIM72Q6ZMU5 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TRIM72Q6ZMU5 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
TRIM72Q6ZMU5 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TRIM72Q6ZMU5 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TRIM72Q6ZMU5 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TRIM72Q6ZMU5 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TRIM72Q6ZMU5 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TRIM72Q6ZMU5 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TRIM72Q6ZMU5 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TRIM72Q6ZMU5 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TRIM72Q6ZMU5 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TRIM72Q6ZMU5 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TRIM72Q6ZMU5 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TRIM72Q6ZMU5 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TRIM72Q6ZMU5 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TRIM72Q6ZMU5 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TRIM72Q6ZMU5 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TRIM72Q6ZMU5 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TRIM72Q6ZMU5 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TRIM72Q6ZMU5 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TRIM72Q6ZMU5 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TRIM72Q6ZMU5 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TRIM72Q6ZMU5 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TRIM72Q6ZMU5 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
TRIM72Q6ZMU5 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
TRIM72Q6ZMU5 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
TRIM72Q6ZMU5 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TRIM72Q6ZMU5 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TRIM72Q6ZMU5 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TRIM72Q6ZMU5 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TRIM72Q6ZMU5 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TRIM72Q6ZMU5 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TRIM72Q6ZMU5 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TRIM72Q6ZMU5 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TRIM72Q6ZMU5 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TRIM72Q6ZMU5 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TRIM72Q6ZMU5 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TRIM72Q6ZMU5 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TRIM72Q6ZMU5 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TRIM72Q6ZMU5 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TRIM72Q6ZMU5 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TRIM72Q6ZMU5 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
TRIM72Q6ZMU5 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC19.14■□□□□ 0.66
TRIM72Q6ZMU5 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
TRIM72Q6ZMU5 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TRIM72Q6ZMU5 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.1 ms