Protein–RNA interactions for Protein: Q6TDU7

CASC1, Protein CASC1, humanhuman

Predictions only

Length 716 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASC1Q6TDU7 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CASC1Q6TDU7 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CASC1Q6TDU7 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CASC1Q6TDU7 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CASC1Q6TDU7 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CASC1Q6TDU7 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CASC1Q6TDU7 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CASC1Q6TDU7 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CASC1Q6TDU7 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CASC1Q6TDU7 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CASC1Q6TDU7 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CASC1Q6TDU7 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CASC1Q6TDU7 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CASC1Q6TDU7 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CASC1Q6TDU7 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
CASC1Q6TDU7 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CASC1Q6TDU7 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CASC1Q6TDU7 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CASC1Q6TDU7 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CASC1Q6TDU7 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CASC1Q6TDU7 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CASC1Q6TDU7 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CASC1Q6TDU7 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CASC1Q6TDU7 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CASC1Q6TDU7 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CASC1Q6TDU7 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CASC1Q6TDU7 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CASC1Q6TDU7 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CASC1Q6TDU7 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CASC1Q6TDU7 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CASC1Q6TDU7 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CASC1Q6TDU7 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CASC1Q6TDU7 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CASC1Q6TDU7 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CASC1Q6TDU7 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CASC1Q6TDU7 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CASC1Q6TDU7 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CASC1Q6TDU7 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CASC1Q6TDU7 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CASC1Q6TDU7 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CASC1Q6TDU7 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CASC1Q6TDU7 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CASC1Q6TDU7 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CASC1Q6TDU7 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CASC1Q6TDU7 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CASC1Q6TDU7 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CASC1Q6TDU7 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
CASC1Q6TDU7 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CASC1Q6TDU7 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CASC1Q6TDU7 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CASC1Q6TDU7 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CASC1Q6TDU7 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CASC1Q6TDU7 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CASC1Q6TDU7 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CASC1Q6TDU7 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CASC1Q6TDU7 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CASC1Q6TDU7 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CASC1Q6TDU7 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CASC1Q6TDU7 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CASC1Q6TDU7 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CASC1Q6TDU7 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CASC1Q6TDU7 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CASC1Q6TDU7 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
CASC1Q6TDU7 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CASC1Q6TDU7 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CASC1Q6TDU7 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CASC1Q6TDU7 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CASC1Q6TDU7 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
CASC1Q6TDU7 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CASC1Q6TDU7 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CASC1Q6TDU7 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CASC1Q6TDU7 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CASC1Q6TDU7 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CASC1Q6TDU7 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CASC1Q6TDU7 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CASC1Q6TDU7 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CASC1Q6TDU7 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CASC1Q6TDU7 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CASC1Q6TDU7 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CASC1Q6TDU7 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CASC1Q6TDU7 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CASC1Q6TDU7 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CASC1Q6TDU7 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CASC1Q6TDU7 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CASC1Q6TDU7 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CASC1Q6TDU7 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CASC1Q6TDU7 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CASC1Q6TDU7 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CASC1Q6TDU7 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CASC1Q6TDU7 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CASC1Q6TDU7 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CASC1Q6TDU7 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CASC1Q6TDU7 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CASC1Q6TDU7 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CASC1Q6TDU7 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CASC1Q6TDU7 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CASC1Q6TDU7 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CASC1Q6TDU7 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CASC1Q6TDU7 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CASC1Q6TDU7 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms