Protein–RNA interactions for Protein: Q6RFH8

DUX4L9, Double homeobox protein 4C, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUX4L9Q6RFH8 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
DUX4L9Q6RFH8 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
DUX4L9Q6RFH8 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
DUX4L9Q6RFH8 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
DUX4L9Q6RFH8 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
DUX4L9Q6RFH8 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
DUX4L9Q6RFH8 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
DUX4L9Q6RFH8 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
DUX4L9Q6RFH8 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
DUX4L9Q6RFH8 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
DUX4L9Q6RFH8 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
DUX4L9Q6RFH8 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
DUX4L9Q6RFH8 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
DUX4L9Q6RFH8 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
DUX4L9Q6RFH8 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
DUX4L9Q6RFH8 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC15.06■□□□□ 0
DUX4L9Q6RFH8 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
DUX4L9Q6RFH8 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
DUX4L9Q6RFH8 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
DUX4L9Q6RFH8 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC15.06■□□□□ 0
DUX4L9Q6RFH8 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
DUX4L9Q6RFH8 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
DUX4L9Q6RFH8 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
DUX4L9Q6RFH8 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
DUX4L9Q6RFH8 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
DUX4L9Q6RFH8 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
DUX4L9Q6RFH8 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
DUX4L9Q6RFH8 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC15.06■□□□□ 0
DUX4L9Q6RFH8 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
DUX4L9Q6RFH8 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
DUX4L9Q6RFH8 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
DUX4L9Q6RFH8 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
DUX4L9Q6RFH8 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
DUX4L9Q6RFH8 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
DUX4L9Q6RFH8 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
DUX4L9Q6RFH8 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
DUX4L9Q6RFH8 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
DUX4L9Q6RFH8 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
DUX4L9Q6RFH8 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
DUX4L9Q6RFH8 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
DUX4L9Q6RFH8 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
DUX4L9Q6RFH8 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
DUX4L9Q6RFH8 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
DUX4L9Q6RFH8 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
DUX4L9Q6RFH8 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
DUX4L9Q6RFH8 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
DUX4L9Q6RFH8 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
DUX4L9Q6RFH8 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
DUX4L9Q6RFH8 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
DUX4L9Q6RFH8 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ 0
DUX4L9Q6RFH8 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
DUX4L9Q6RFH8 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
DUX4L9Q6RFH8 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
DUX4L9Q6RFH8 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
DUX4L9Q6RFH8 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
DUX4L9Q6RFH8 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
DUX4L9Q6RFH8 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
DUX4L9Q6RFH8 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
DUX4L9Q6RFH8 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
DUX4L9Q6RFH8 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC15.05■□□□□ -0
DUX4L9Q6RFH8 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
DUX4L9Q6RFH8 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
DUX4L9Q6RFH8 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
DUX4L9Q6RFH8 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
DUX4L9Q6RFH8 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
DUX4L9Q6RFH8 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
DUX4L9Q6RFH8 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
DUX4L9Q6RFH8 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
DUX4L9Q6RFH8 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
DUX4L9Q6RFH8 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
DUX4L9Q6RFH8 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
DUX4L9Q6RFH8 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
DUX4L9Q6RFH8 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC15.05■□□□□ -0
DUX4L9Q6RFH8 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
DUX4L9Q6RFH8 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
DUX4L9Q6RFH8 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
DUX4L9Q6RFH8 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
DUX4L9Q6RFH8 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
DUX4L9Q6RFH8 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
DUX4L9Q6RFH8 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
DUX4L9Q6RFH8 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
DUX4L9Q6RFH8 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
DUX4L9Q6RFH8 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
DUX4L9Q6RFH8 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
DUX4L9Q6RFH8 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
DUX4L9Q6RFH8 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
DUX4L9Q6RFH8 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
DUX4L9Q6RFH8 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
DUX4L9Q6RFH8 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
DUX4L9Q6RFH8 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
DUX4L9Q6RFH8 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
DUX4L9Q6RFH8 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
DUX4L9Q6RFH8 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
DUX4L9Q6RFH8 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
DUX4L9Q6RFH8 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
DUX4L9Q6RFH8 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
DUX4L9Q6RFH8 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
DUX4L9Q6RFH8 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
DUX4L9Q6RFH8 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
DUX4L9Q6RFH8 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms