Protein–RNA interactions for Protein: Q6P1Q0

LETMD1, LETM1 domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LETMD1Q6P1Q0 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
LETMD1Q6P1Q0 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
LETMD1Q6P1Q0 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
LETMD1Q6P1Q0 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
LETMD1Q6P1Q0 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
LETMD1Q6P1Q0 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
LETMD1Q6P1Q0 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
LETMD1Q6P1Q0 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
LETMD1Q6P1Q0 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
LETMD1Q6P1Q0 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
LETMD1Q6P1Q0 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
LETMD1Q6P1Q0 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
LETMD1Q6P1Q0 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
LETMD1Q6P1Q0 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
LETMD1Q6P1Q0 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
LETMD1Q6P1Q0 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
LETMD1Q6P1Q0 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
LETMD1Q6P1Q0 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
LETMD1Q6P1Q0 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
LETMD1Q6P1Q0 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
LETMD1Q6P1Q0 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
LETMD1Q6P1Q0 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
LETMD1Q6P1Q0 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
LETMD1Q6P1Q0 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
LETMD1Q6P1Q0 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
LETMD1Q6P1Q0 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
LETMD1Q6P1Q0 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
LETMD1Q6P1Q0 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
LETMD1Q6P1Q0 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
LETMD1Q6P1Q0 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
LETMD1Q6P1Q0 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
LETMD1Q6P1Q0 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
LETMD1Q6P1Q0 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
LETMD1Q6P1Q0 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
LETMD1Q6P1Q0 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
LETMD1Q6P1Q0 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
LETMD1Q6P1Q0 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
LETMD1Q6P1Q0 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
LETMD1Q6P1Q0 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
LETMD1Q6P1Q0 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
LETMD1Q6P1Q0 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
LETMD1Q6P1Q0 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
LETMD1Q6P1Q0 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
LETMD1Q6P1Q0 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
LETMD1Q6P1Q0 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
LETMD1Q6P1Q0 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
LETMD1Q6P1Q0 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
LETMD1Q6P1Q0 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
LETMD1Q6P1Q0 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
LETMD1Q6P1Q0 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
LETMD1Q6P1Q0 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
LETMD1Q6P1Q0 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
LETMD1Q6P1Q0 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
LETMD1Q6P1Q0 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
LETMD1Q6P1Q0 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
LETMD1Q6P1Q0 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.49■□□□□ 0.39
LETMD1Q6P1Q0 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
LETMD1Q6P1Q0 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
LETMD1Q6P1Q0 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
LETMD1Q6P1Q0 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
LETMD1Q6P1Q0 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
LETMD1Q6P1Q0 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
LETMD1Q6P1Q0 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
LETMD1Q6P1Q0 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
LETMD1Q6P1Q0 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
LETMD1Q6P1Q0 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
LETMD1Q6P1Q0 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC17.49■□□□□ 0.39
LETMD1Q6P1Q0 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
LETMD1Q6P1Q0 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
LETMD1Q6P1Q0 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
LETMD1Q6P1Q0 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
LETMD1Q6P1Q0 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
LETMD1Q6P1Q0 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
LETMD1Q6P1Q0 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
LETMD1Q6P1Q0 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
LETMD1Q6P1Q0 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
LETMD1Q6P1Q0 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
LETMD1Q6P1Q0 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
LETMD1Q6P1Q0 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
LETMD1Q6P1Q0 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
LETMD1Q6P1Q0 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
LETMD1Q6P1Q0 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
LETMD1Q6P1Q0 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
LETMD1Q6P1Q0 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
LETMD1Q6P1Q0 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
LETMD1Q6P1Q0 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
LETMD1Q6P1Q0 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.48■□□□□ 0.39
LETMD1Q6P1Q0 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
LETMD1Q6P1Q0 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
LETMD1Q6P1Q0 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
LETMD1Q6P1Q0 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
LETMD1Q6P1Q0 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
LETMD1Q6P1Q0 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
LETMD1Q6P1Q0 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
LETMD1Q6P1Q0 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
LETMD1Q6P1Q0 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
LETMD1Q6P1Q0 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
LETMD1Q6P1Q0 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
LETMD1Q6P1Q0 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
LETMD1Q6P1Q0 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45 ms