Protein–RNA interactions for Protein: Q6AI14

SLC9A4, Sodium/hydrogen exchanger 4, humanhuman

Predictions only

Length 798 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC9A4Q6AI14 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SLC9A4Q6AI14 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SLC9A4Q6AI14 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SLC9A4Q6AI14 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SLC9A4Q6AI14 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SLC9A4Q6AI14 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SLC9A4Q6AI14 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SLC9A4Q6AI14 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SLC9A4Q6AI14 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SLC9A4Q6AI14 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SLC9A4Q6AI14 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SLC9A4Q6AI14 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SLC9A4Q6AI14 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SLC9A4Q6AI14 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SLC9A4Q6AI14 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SLC9A4Q6AI14 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SLC9A4Q6AI14 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SLC9A4Q6AI14 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SLC9A4Q6AI14 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SLC9A4Q6AI14 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SLC9A4Q6AI14 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SLC9A4Q6AI14 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
SLC9A4Q6AI14 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SLC9A4Q6AI14 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SLC9A4Q6AI14 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SLC9A4Q6AI14 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SLC9A4Q6AI14 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SLC9A4Q6AI14 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SLC9A4Q6AI14 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SLC9A4Q6AI14 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SLC9A4Q6AI14 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SLC9A4Q6AI14 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SLC9A4Q6AI14 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SLC9A4Q6AI14 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SLC9A4Q6AI14 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SLC9A4Q6AI14 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SLC9A4Q6AI14 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SLC9A4Q6AI14 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SLC9A4Q6AI14 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SLC9A4Q6AI14 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SLC9A4Q6AI14 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SLC9A4Q6AI14 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SLC9A4Q6AI14 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SLC9A4Q6AI14 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SLC9A4Q6AI14 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SLC9A4Q6AI14 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SLC9A4Q6AI14 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SLC9A4Q6AI14 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SLC9A4Q6AI14 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SLC9A4Q6AI14 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SLC9A4Q6AI14 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
SLC9A4Q6AI14 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SLC9A4Q6AI14 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SLC9A4Q6AI14 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SLC9A4Q6AI14 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SLC9A4Q6AI14 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SLC9A4Q6AI14 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
SLC9A4Q6AI14 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
SLC9A4Q6AI14 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
SLC9A4Q6AI14 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SLC9A4Q6AI14 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SLC9A4Q6AI14 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SLC9A4Q6AI14 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SLC9A4Q6AI14 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SLC9A4Q6AI14 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SLC9A4Q6AI14 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SLC9A4Q6AI14 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SLC9A4Q6AI14 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SLC9A4Q6AI14 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SLC9A4Q6AI14 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SLC9A4Q6AI14 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SLC9A4Q6AI14 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SLC9A4Q6AI14 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SLC9A4Q6AI14 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SLC9A4Q6AI14 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SLC9A4Q6AI14 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SLC9A4Q6AI14 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SLC9A4Q6AI14 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
SLC9A4Q6AI14 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
SLC9A4Q6AI14 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
SLC9A4Q6AI14 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
SLC9A4Q6AI14 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
SLC9A4Q6AI14 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
SLC9A4Q6AI14 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
SLC9A4Q6AI14 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
SLC9A4Q6AI14 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
SLC9A4Q6AI14 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
SLC9A4Q6AI14 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
SLC9A4Q6AI14 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
SLC9A4Q6AI14 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
SLC9A4Q6AI14 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.57
SLC9A4Q6AI14 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
SLC9A4Q6AI14 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SLC9A4Q6AI14 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SLC9A4Q6AI14 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SLC9A4Q6AI14 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SLC9A4Q6AI14 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SLC9A4Q6AI14 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SLC9A4Q6AI14 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SLC9A4Q6AI14 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms