Protein–RNA interactions for Protein: Q68E01

INTS3, Integrator complex subunit 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,043 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
INTS3Q68E01 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
INTS3Q68E01 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
INTS3Q68E01 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
INTS3Q68E01 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
INTS3Q68E01 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
INTS3Q68E01 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
INTS3Q68E01 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
INTS3Q68E01 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
INTS3Q68E01 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
INTS3Q68E01 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
INTS3Q68E01 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
INTS3Q68E01 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
INTS3Q68E01 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
INTS3Q68E01 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
INTS3Q68E01 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
INTS3Q68E01 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
INTS3Q68E01 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
INTS3Q68E01 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
INTS3Q68E01 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
INTS3Q68E01 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
INTS3Q68E01 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
INTS3Q68E01 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
INTS3Q68E01 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
INTS3Q68E01 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
INTS3Q68E01 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
INTS3Q68E01 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
INTS3Q68E01 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
INTS3Q68E01 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
INTS3Q68E01 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
INTS3Q68E01 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
INTS3Q68E01 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
INTS3Q68E01 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
INTS3Q68E01 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
INTS3Q68E01 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
INTS3Q68E01 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
INTS3Q68E01 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
INTS3Q68E01 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
INTS3Q68E01 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
INTS3Q68E01 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
INTS3Q68E01 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
INTS3Q68E01 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
INTS3Q68E01 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
INTS3Q68E01 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
INTS3Q68E01 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
INTS3Q68E01 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
INTS3Q68E01 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
INTS3Q68E01 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
INTS3Q68E01 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
INTS3Q68E01 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
INTS3Q68E01 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
INTS3Q68E01 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
INTS3Q68E01 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
INTS3Q68E01 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
INTS3Q68E01 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
INTS3Q68E01 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
INTS3Q68E01 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
INTS3Q68E01 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
INTS3Q68E01 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
INTS3Q68E01 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
INTS3Q68E01 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
INTS3Q68E01 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
INTS3Q68E01 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
INTS3Q68E01 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
INTS3Q68E01 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
INTS3Q68E01 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
INTS3Q68E01 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
INTS3Q68E01 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
INTS3Q68E01 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
INTS3Q68E01 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
INTS3Q68E01 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
INTS3Q68E01 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
INTS3Q68E01 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
INTS3Q68E01 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
INTS3Q68E01 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
INTS3Q68E01 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
INTS3Q68E01 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
INTS3Q68E01 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
INTS3Q68E01 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
INTS3Q68E01 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
INTS3Q68E01 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
INTS3Q68E01 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
INTS3Q68E01 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
INTS3Q68E01 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
INTS3Q68E01 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
INTS3Q68E01 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
INTS3Q68E01 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
INTS3Q68E01 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
INTS3Q68E01 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
INTS3Q68E01 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
INTS3Q68E01 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
INTS3Q68E01 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
INTS3Q68E01 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
INTS3Q68E01 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
INTS3Q68E01 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
INTS3Q68E01 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
INTS3Q68E01 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
INTS3Q68E01 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
INTS3Q68E01 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
INTS3Q68E01 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
INTS3Q68E01 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50 ms