Protein–RNA interactions for Protein: Q5TGJ6

HDGFL1, Hepatoma-derived growth factor-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 251 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDGFL1Q5TGJ6 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
HDGFL1Q5TGJ6 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
HDGFL1Q5TGJ6 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
HDGFL1Q5TGJ6 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
HDGFL1Q5TGJ6 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
HDGFL1Q5TGJ6 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
HDGFL1Q5TGJ6 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
HDGFL1Q5TGJ6 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
HDGFL1Q5TGJ6 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC23.02■■□□□ 1.28
HDGFL1Q5TGJ6 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
HDGFL1Q5TGJ6 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
HDGFL1Q5TGJ6 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
HDGFL1Q5TGJ6 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
HDGFL1Q5TGJ6 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
HDGFL1Q5TGJ6 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
HDGFL1Q5TGJ6 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
HDGFL1Q5TGJ6 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
HDGFL1Q5TGJ6 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
HDGFL1Q5TGJ6 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
HDGFL1Q5TGJ6 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
HDGFL1Q5TGJ6 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
HDGFL1Q5TGJ6 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
HDGFL1Q5TGJ6 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
HDGFL1Q5TGJ6 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
HDGFL1Q5TGJ6 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
HDGFL1Q5TGJ6 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
HDGFL1Q5TGJ6 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
HDGFL1Q5TGJ6 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
HDGFL1Q5TGJ6 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
HDGFL1Q5TGJ6 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
HDGFL1Q5TGJ6 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
HDGFL1Q5TGJ6 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
HDGFL1Q5TGJ6 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
HDGFL1Q5TGJ6 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
HDGFL1Q5TGJ6 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
HDGFL1Q5TGJ6 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
HDGFL1Q5TGJ6 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
HDGFL1Q5TGJ6 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
HDGFL1Q5TGJ6 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
HDGFL1Q5TGJ6 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
HDGFL1Q5TGJ6 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
HDGFL1Q5TGJ6 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
HDGFL1Q5TGJ6 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC23■■□□□ 1.27
HDGFL1Q5TGJ6 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
HDGFL1Q5TGJ6 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
HDGFL1Q5TGJ6 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
HDGFL1Q5TGJ6 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
HDGFL1Q5TGJ6 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
HDGFL1Q5TGJ6 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
HDGFL1Q5TGJ6 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
HDGFL1Q5TGJ6 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
HDGFL1Q5TGJ6 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
HDGFL1Q5TGJ6 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
HDGFL1Q5TGJ6 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
HDGFL1Q5TGJ6 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
HDGFL1Q5TGJ6 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC23■■□□□ 1.27
HDGFL1Q5TGJ6 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
HDGFL1Q5TGJ6 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
HDGFL1Q5TGJ6 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
HDGFL1Q5TGJ6 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
HDGFL1Q5TGJ6 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
HDGFL1Q5TGJ6 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
HDGFL1Q5TGJ6 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
HDGFL1Q5TGJ6 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
HDGFL1Q5TGJ6 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
HDGFL1Q5TGJ6 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
HDGFL1Q5TGJ6 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
HDGFL1Q5TGJ6 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
HDGFL1Q5TGJ6 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
HDGFL1Q5TGJ6 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
HDGFL1Q5TGJ6 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
HDGFL1Q5TGJ6 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
HDGFL1Q5TGJ6 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
HDGFL1Q5TGJ6 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
HDGFL1Q5TGJ6 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
HDGFL1Q5TGJ6 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
HDGFL1Q5TGJ6 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
HDGFL1Q5TGJ6 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
HDGFL1Q5TGJ6 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
HDGFL1Q5TGJ6 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
HDGFL1Q5TGJ6 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
HDGFL1Q5TGJ6 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
HDGFL1Q5TGJ6 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
HDGFL1Q5TGJ6 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
HDGFL1Q5TGJ6 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
HDGFL1Q5TGJ6 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
HDGFL1Q5TGJ6 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
HDGFL1Q5TGJ6 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
HDGFL1Q5TGJ6 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
HDGFL1Q5TGJ6 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
HDGFL1Q5TGJ6 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
HDGFL1Q5TGJ6 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
HDGFL1Q5TGJ6 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
HDGFL1Q5TGJ6 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
HDGFL1Q5TGJ6 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
HDGFL1Q5TGJ6 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
HDGFL1Q5TGJ6 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
HDGFL1Q5TGJ6 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
HDGFL1Q5TGJ6 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
HDGFL1Q5TGJ6 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms