Protein–RNA interactions for Protein: Q5T2N8

ATAD3C, ATPase family AAA domain-containing protein 3C, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATAD3CQ5T2N8 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
ATAD3CQ5T2N8 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATAD3CQ5T2N8 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATAD3CQ5T2N8 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
ATAD3CQ5T2N8 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATAD3CQ5T2N8 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATAD3CQ5T2N8 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATAD3CQ5T2N8 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATAD3CQ5T2N8 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATAD3CQ5T2N8 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATAD3CQ5T2N8 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATAD3CQ5T2N8 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATAD3CQ5T2N8 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATAD3CQ5T2N8 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATAD3CQ5T2N8 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATAD3CQ5T2N8 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATAD3CQ5T2N8 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATAD3CQ5T2N8 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATAD3CQ5T2N8 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATAD3CQ5T2N8 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATAD3CQ5T2N8 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATAD3CQ5T2N8 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATAD3CQ5T2N8 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATAD3CQ5T2N8 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATAD3CQ5T2N8 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
ATAD3CQ5T2N8 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
ATAD3CQ5T2N8 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
ATAD3CQ5T2N8 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATAD3CQ5T2N8 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
ATAD3CQ5T2N8 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATAD3CQ5T2N8 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATAD3CQ5T2N8 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATAD3CQ5T2N8 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATAD3CQ5T2N8 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATAD3CQ5T2N8 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATAD3CQ5T2N8 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATAD3CQ5T2N8 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATAD3CQ5T2N8 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATAD3CQ5T2N8 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATAD3CQ5T2N8 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
ATAD3CQ5T2N8 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATAD3CQ5T2N8 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATAD3CQ5T2N8 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATAD3CQ5T2N8 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATAD3CQ5T2N8 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATAD3CQ5T2N8 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATAD3CQ5T2N8 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATAD3CQ5T2N8 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATAD3CQ5T2N8 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATAD3CQ5T2N8 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATAD3CQ5T2N8 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATAD3CQ5T2N8 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATAD3CQ5T2N8 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATAD3CQ5T2N8 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATAD3CQ5T2N8 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATAD3CQ5T2N8 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
ATAD3CQ5T2N8 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATAD3CQ5T2N8 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATAD3CQ5T2N8 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATAD3CQ5T2N8 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATAD3CQ5T2N8 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATAD3CQ5T2N8 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATAD3CQ5T2N8 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATAD3CQ5T2N8 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATAD3CQ5T2N8 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATAD3CQ5T2N8 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATAD3CQ5T2N8 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATAD3CQ5T2N8 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATAD3CQ5T2N8 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATAD3CQ5T2N8 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATAD3CQ5T2N8 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATAD3CQ5T2N8 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATAD3CQ5T2N8 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATAD3CQ5T2N8 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATAD3CQ5T2N8 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATAD3CQ5T2N8 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATAD3CQ5T2N8 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATAD3CQ5T2N8 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATAD3CQ5T2N8 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATAD3CQ5T2N8 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATAD3CQ5T2N8 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATAD3CQ5T2N8 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATAD3CQ5T2N8 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATAD3CQ5T2N8 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATAD3CQ5T2N8 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATAD3CQ5T2N8 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATAD3CQ5T2N8 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATAD3CQ5T2N8 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATAD3CQ5T2N8 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATAD3CQ5T2N8 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATAD3CQ5T2N8 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATAD3CQ5T2N8 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATAD3CQ5T2N8 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATAD3CQ5T2N8 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATAD3CQ5T2N8 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATAD3CQ5T2N8 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATAD3CQ5T2N8 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATAD3CQ5T2N8 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATAD3CQ5T2N8 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
ATAD3CQ5T2N8 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.7 ms