Protein–RNA interactions for Protein: Q5SWW7

C10orf55, Uncharacterized protein C10orf55, humanhuman

Predictions only

Length 151 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C10orf55Q5SWW7 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
C10orf55Q5SWW7 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
C10orf55Q5SWW7 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
C10orf55Q5SWW7 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
C10orf55Q5SWW7 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
C10orf55Q5SWW7 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
C10orf55Q5SWW7 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
C10orf55Q5SWW7 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
C10orf55Q5SWW7 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
C10orf55Q5SWW7 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
C10orf55Q5SWW7 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
C10orf55Q5SWW7 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
C10orf55Q5SWW7 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
C10orf55Q5SWW7 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
C10orf55Q5SWW7 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
C10orf55Q5SWW7 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
C10orf55Q5SWW7 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
C10orf55Q5SWW7 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
C10orf55Q5SWW7 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
C10orf55Q5SWW7 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
C10orf55Q5SWW7 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
C10orf55Q5SWW7 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
C10orf55Q5SWW7 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
C10orf55Q5SWW7 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
C10orf55Q5SWW7 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
C10orf55Q5SWW7 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
C10orf55Q5SWW7 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
C10orf55Q5SWW7 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
C10orf55Q5SWW7 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
C10orf55Q5SWW7 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
C10orf55Q5SWW7 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
C10orf55Q5SWW7 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
C10orf55Q5SWW7 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
C10orf55Q5SWW7 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
C10orf55Q5SWW7 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
C10orf55Q5SWW7 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
C10orf55Q5SWW7 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
C10orf55Q5SWW7 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
C10orf55Q5SWW7 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
C10orf55Q5SWW7 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
C10orf55Q5SWW7 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
C10orf55Q5SWW7 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
C10orf55Q5SWW7 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
C10orf55Q5SWW7 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
C10orf55Q5SWW7 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
C10orf55Q5SWW7 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
C10orf55Q5SWW7 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
C10orf55Q5SWW7 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
C10orf55Q5SWW7 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
C10orf55Q5SWW7 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
C10orf55Q5SWW7 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
C10orf55Q5SWW7 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
C10orf55Q5SWW7 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
C10orf55Q5SWW7 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
C10orf55Q5SWW7 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
C10orf55Q5SWW7 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
C10orf55Q5SWW7 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
C10orf55Q5SWW7 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
C10orf55Q5SWW7 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
C10orf55Q5SWW7 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
C10orf55Q5SWW7 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
C10orf55Q5SWW7 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
C10orf55Q5SWW7 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
C10orf55Q5SWW7 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
C10orf55Q5SWW7 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
C10orf55Q5SWW7 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
C10orf55Q5SWW7 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
C10orf55Q5SWW7 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
C10orf55Q5SWW7 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
C10orf55Q5SWW7 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
C10orf55Q5SWW7 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
C10orf55Q5SWW7 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
C10orf55Q5SWW7 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
C10orf55Q5SWW7 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
C10orf55Q5SWW7 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
C10orf55Q5SWW7 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
C10orf55Q5SWW7 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
C10orf55Q5SWW7 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
C10orf55Q5SWW7 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
C10orf55Q5SWW7 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
C10orf55Q5SWW7 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
C10orf55Q5SWW7 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
C10orf55Q5SWW7 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
C10orf55Q5SWW7 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
C10orf55Q5SWW7 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
C10orf55Q5SWW7 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
C10orf55Q5SWW7 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
C10orf55Q5SWW7 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
C10orf55Q5SWW7 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
C10orf55Q5SWW7 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
C10orf55Q5SWW7 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
C10orf55Q5SWW7 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
C10orf55Q5SWW7 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
C10orf55Q5SWW7 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
C10orf55Q5SWW7 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
C10orf55Q5SWW7 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
C10orf55Q5SWW7 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
C10orf55Q5SWW7 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
C10orf55Q5SWW7 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
C10orf55Q5SWW7 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.9 ms