Protein–RNA interactions for Protein: Q5SW96

LDLRAP1, Low density lipoprotein receptor adapter protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LDLRAP1Q5SW96 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LDLRAP1Q5SW96 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LDLRAP1Q5SW96 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
LDLRAP1Q5SW96 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
LDLRAP1Q5SW96 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LDLRAP1Q5SW96 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC18■□□□□ 0.47
LDLRAP1Q5SW96 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
LDLRAP1Q5SW96 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LDLRAP1Q5SW96 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
LDLRAP1Q5SW96 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
LDLRAP1Q5SW96 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LDLRAP1Q5SW96 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
LDLRAP1Q5SW96 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
LDLRAP1Q5SW96 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
LDLRAP1Q5SW96 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC18■□□□□ 0.47
LDLRAP1Q5SW96 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
LDLRAP1Q5SW96 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
LDLRAP1Q5SW96 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
LDLRAP1Q5SW96 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
LDLRAP1Q5SW96 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
LDLRAP1Q5SW96 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
LDLRAP1Q5SW96 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC18■□□□□ 0.47
LDLRAP1Q5SW96 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC18■□□□□ 0.47
LDLRAP1Q5SW96 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC18■□□□□ 0.47
LDLRAP1Q5SW96 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC18■□□□□ 0.47
LDLRAP1Q5SW96 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LDLRAP1Q5SW96 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
LDLRAP1Q5SW96 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
LDLRAP1Q5SW96 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
LDLRAP1Q5SW96 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
LDLRAP1Q5SW96 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LDLRAP1Q5SW96 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
LDLRAP1Q5SW96 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
LDLRAP1Q5SW96 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LDLRAP1Q5SW96 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LDLRAP1Q5SW96 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LDLRAP1Q5SW96 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
LDLRAP1Q5SW96 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
LDLRAP1Q5SW96 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LDLRAP1Q5SW96 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LDLRAP1Q5SW96 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LDLRAP1Q5SW96 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
LDLRAP1Q5SW96 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LDLRAP1Q5SW96 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LDLRAP1Q5SW96 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
LDLRAP1Q5SW96 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
LDLRAP1Q5SW96 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LDLRAP1Q5SW96 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LDLRAP1Q5SW96 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LDLRAP1Q5SW96 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
LDLRAP1Q5SW96 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LDLRAP1Q5SW96 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LDLRAP1Q5SW96 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LDLRAP1Q5SW96 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
LDLRAP1Q5SW96 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
LDLRAP1Q5SW96 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
LDLRAP1Q5SW96 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
LDLRAP1Q5SW96 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
LDLRAP1Q5SW96 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
LDLRAP1Q5SW96 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
LDLRAP1Q5SW96 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
LDLRAP1Q5SW96 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
LDLRAP1Q5SW96 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
LDLRAP1Q5SW96 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
LDLRAP1Q5SW96 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LDLRAP1Q5SW96 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LDLRAP1Q5SW96 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
LDLRAP1Q5SW96 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LDLRAP1Q5SW96 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LDLRAP1Q5SW96 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
LDLRAP1Q5SW96 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
LDLRAP1Q5SW96 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
LDLRAP1Q5SW96 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
LDLRAP1Q5SW96 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
LDLRAP1Q5SW96 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
LDLRAP1Q5SW96 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
LDLRAP1Q5SW96 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
LDLRAP1Q5SW96 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
LDLRAP1Q5SW96 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
LDLRAP1Q5SW96 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
LDLRAP1Q5SW96 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
LDLRAP1Q5SW96 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
LDLRAP1Q5SW96 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
LDLRAP1Q5SW96 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
LDLRAP1Q5SW96 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
LDLRAP1Q5SW96 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
LDLRAP1Q5SW96 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
LDLRAP1Q5SW96 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
LDLRAP1Q5SW96 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
LDLRAP1Q5SW96 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
LDLRAP1Q5SW96 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
LDLRAP1Q5SW96 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
LDLRAP1Q5SW96 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
LDLRAP1Q5SW96 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
LDLRAP1Q5SW96 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
LDLRAP1Q5SW96 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
LDLRAP1Q5SW96 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
LDLRAP1Q5SW96 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
LDLRAP1Q5SW96 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
LDLRAP1Q5SW96 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63 ms