Protein–RNA interactions for Protein: Q53FE4

C4orf17, Uncharacterized protein C4orf17, humanhuman

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4orf17Q53FE4 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
C4orf17Q53FE4 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
C4orf17Q53FE4 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
C4orf17Q53FE4 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
C4orf17Q53FE4 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
C4orf17Q53FE4 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
C4orf17Q53FE4 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
C4orf17Q53FE4 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
C4orf17Q53FE4 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
C4orf17Q53FE4 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
C4orf17Q53FE4 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
C4orf17Q53FE4 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
C4orf17Q53FE4 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
C4orf17Q53FE4 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
C4orf17Q53FE4 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
C4orf17Q53FE4 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
C4orf17Q53FE4 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
C4orf17Q53FE4 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
C4orf17Q53FE4 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
C4orf17Q53FE4 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
C4orf17Q53FE4 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
C4orf17Q53FE4 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
C4orf17Q53FE4 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
C4orf17Q53FE4 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
C4orf17Q53FE4 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
C4orf17Q53FE4 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
C4orf17Q53FE4 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
C4orf17Q53FE4 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
C4orf17Q53FE4 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
C4orf17Q53FE4 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
C4orf17Q53FE4 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
C4orf17Q53FE4 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
C4orf17Q53FE4 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
C4orf17Q53FE4 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC16.26■□□□□ 0.19
C4orf17Q53FE4 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
C4orf17Q53FE4 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
C4orf17Q53FE4 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
C4orf17Q53FE4 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
C4orf17Q53FE4 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
C4orf17Q53FE4 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
C4orf17Q53FE4 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
C4orf17Q53FE4 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
C4orf17Q53FE4 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
C4orf17Q53FE4 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
C4orf17Q53FE4 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
C4orf17Q53FE4 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
C4orf17Q53FE4 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
C4orf17Q53FE4 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
C4orf17Q53FE4 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
C4orf17Q53FE4 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
C4orf17Q53FE4 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
C4orf17Q53FE4 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
C4orf17Q53FE4 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
C4orf17Q53FE4 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
C4orf17Q53FE4 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
C4orf17Q53FE4 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
C4orf17Q53FE4 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
C4orf17Q53FE4 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
C4orf17Q53FE4 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
C4orf17Q53FE4 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
C4orf17Q53FE4 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
C4orf17Q53FE4 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
C4orf17Q53FE4 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
C4orf17Q53FE4 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
C4orf17Q53FE4 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
C4orf17Q53FE4 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
C4orf17Q53FE4 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
C4orf17Q53FE4 MRPL53-201ENST00000258105 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
C4orf17Q53FE4 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
C4orf17Q53FE4 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
C4orf17Q53FE4 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
C4orf17Q53FE4 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
C4orf17Q53FE4 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
C4orf17Q53FE4 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
C4orf17Q53FE4 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
C4orf17Q53FE4 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
C4orf17Q53FE4 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
C4orf17Q53FE4 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
C4orf17Q53FE4 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
C4orf17Q53FE4 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
C4orf17Q53FE4 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
C4orf17Q53FE4 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
C4orf17Q53FE4 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
C4orf17Q53FE4 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
C4orf17Q53FE4 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
C4orf17Q53FE4 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
C4orf17Q53FE4 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
C4orf17Q53FE4 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
C4orf17Q53FE4 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
C4orf17Q53FE4 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
C4orf17Q53FE4 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
C4orf17Q53FE4 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
C4orf17Q53FE4 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
C4orf17Q53FE4 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
C4orf17Q53FE4 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
C4orf17Q53FE4 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
C4orf17Q53FE4 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
C4orf17Q53FE4 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
C4orf17Q53FE4 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
C4orf17Q53FE4 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.8 ms