Protein–RNA interactions for Protein: Q4ZIN3

TMEM259, Membralin, humanhuman

Predictions only

Length 620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM259Q4ZIN3 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TMEM259Q4ZIN3 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TMEM259Q4ZIN3 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TMEM259Q4ZIN3 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TMEM259Q4ZIN3 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TMEM259Q4ZIN3 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TMEM259Q4ZIN3 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TMEM259Q4ZIN3 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TMEM259Q4ZIN3 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TMEM259Q4ZIN3 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TMEM259Q4ZIN3 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TMEM259Q4ZIN3 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TMEM259Q4ZIN3 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TMEM259Q4ZIN3 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TMEM259Q4ZIN3 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TMEM259Q4ZIN3 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TMEM259Q4ZIN3 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TMEM259Q4ZIN3 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TMEM259Q4ZIN3 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
TMEM259Q4ZIN3 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TMEM259Q4ZIN3 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
TMEM259Q4ZIN3 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
TMEM259Q4ZIN3 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
TMEM259Q4ZIN3 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TMEM259Q4ZIN3 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TMEM259Q4ZIN3 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TMEM259Q4ZIN3 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TMEM259Q4ZIN3 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TMEM259Q4ZIN3 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TMEM259Q4ZIN3 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TMEM259Q4ZIN3 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TMEM259Q4ZIN3 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TMEM259Q4ZIN3 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TMEM259Q4ZIN3 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TMEM259Q4ZIN3 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TMEM259Q4ZIN3 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TMEM259Q4ZIN3 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TMEM259Q4ZIN3 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TMEM259Q4ZIN3 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TMEM259Q4ZIN3 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TMEM259Q4ZIN3 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TMEM259Q4ZIN3 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
TMEM259Q4ZIN3 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
TMEM259Q4ZIN3 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TMEM259Q4ZIN3 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TMEM259Q4ZIN3 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TMEM259Q4ZIN3 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TMEM259Q4ZIN3 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TMEM259Q4ZIN3 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TMEM259Q4ZIN3 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TMEM259Q4ZIN3 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TMEM259Q4ZIN3 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TMEM259Q4ZIN3 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TMEM259Q4ZIN3 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TMEM259Q4ZIN3 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TMEM259Q4ZIN3 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TMEM259Q4ZIN3 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TMEM259Q4ZIN3 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
TMEM259Q4ZIN3 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TMEM259Q4ZIN3 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
TMEM259Q4ZIN3 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TMEM259Q4ZIN3 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
TMEM259Q4ZIN3 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
TMEM259Q4ZIN3 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TMEM259Q4ZIN3 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TMEM259Q4ZIN3 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TMEM259Q4ZIN3 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TMEM259Q4ZIN3 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TMEM259Q4ZIN3 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TMEM259Q4ZIN3 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TMEM259Q4ZIN3 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TMEM259Q4ZIN3 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TMEM259Q4ZIN3 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TMEM259Q4ZIN3 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TMEM259Q4ZIN3 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TMEM259Q4ZIN3 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TMEM259Q4ZIN3 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TMEM259Q4ZIN3 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TMEM259Q4ZIN3 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TMEM259Q4ZIN3 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
TMEM259Q4ZIN3 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TMEM259Q4ZIN3 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TMEM259Q4ZIN3 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TMEM259Q4ZIN3 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
TMEM259Q4ZIN3 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TMEM259Q4ZIN3 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TMEM259Q4ZIN3 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TMEM259Q4ZIN3 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TMEM259Q4ZIN3 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TMEM259Q4ZIN3 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TMEM259Q4ZIN3 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TMEM259Q4ZIN3 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TMEM259Q4ZIN3 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TMEM259Q4ZIN3 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TMEM259Q4ZIN3 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TMEM259Q4ZIN3 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TMEM259Q4ZIN3 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TMEM259Q4ZIN3 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
TMEM259Q4ZIN3 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
TMEM259Q4ZIN3 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms