Protein–RNA interactions for Protein: Q4KMQ1

TPRN, Taperin, humanhuman

Predictions only

Length 711 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPRNQ4KMQ1 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TPRNQ4KMQ1 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TPRNQ4KMQ1 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
TPRNQ4KMQ1 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
TPRNQ4KMQ1 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
TPRNQ4KMQ1 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TPRNQ4KMQ1 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TPRNQ4KMQ1 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
TPRNQ4KMQ1 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
TPRNQ4KMQ1 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
TPRNQ4KMQ1 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TPRNQ4KMQ1 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TPRNQ4KMQ1 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TPRNQ4KMQ1 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
TPRNQ4KMQ1 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
TPRNQ4KMQ1 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TPRNQ4KMQ1 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TPRNQ4KMQ1 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TPRNQ4KMQ1 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TPRNQ4KMQ1 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TPRNQ4KMQ1 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TPRNQ4KMQ1 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
TPRNQ4KMQ1 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
TPRNQ4KMQ1 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
TPRNQ4KMQ1 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TPRNQ4KMQ1 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TPRNQ4KMQ1 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TPRNQ4KMQ1 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
TPRNQ4KMQ1 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
TPRNQ4KMQ1 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TPRNQ4KMQ1 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
TPRNQ4KMQ1 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TPRNQ4KMQ1 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC21.31■■□□□ 1
TPRNQ4KMQ1 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
TPRNQ4KMQ1 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC21.31■■□□□ 1
TPRNQ4KMQ1 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
TPRNQ4KMQ1 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TPRNQ4KMQ1 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TPRNQ4KMQ1 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
TPRNQ4KMQ1 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TPRNQ4KMQ1 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
TPRNQ4KMQ1 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
TPRNQ4KMQ1 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TPRNQ4KMQ1 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TPRNQ4KMQ1 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC21.31■■□□□ 1
TPRNQ4KMQ1 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TPRNQ4KMQ1 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TPRNQ4KMQ1 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TPRNQ4KMQ1 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
TPRNQ4KMQ1 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TPRNQ4KMQ1 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
TPRNQ4KMQ1 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TPRNQ4KMQ1 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
TPRNQ4KMQ1 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TPRNQ4KMQ1 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TPRNQ4KMQ1 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
TPRNQ4KMQ1 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TPRNQ4KMQ1 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
TPRNQ4KMQ1 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
TPRNQ4KMQ1 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TPRNQ4KMQ1 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
TPRNQ4KMQ1 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
TPRNQ4KMQ1 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC21.3■■□□□ 1
TPRNQ4KMQ1 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TPRNQ4KMQ1 AC124312.2-201ENST00000546615 427 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
TPRNQ4KMQ1 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
TPRNQ4KMQ1 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC21.3■■□□□ 1
TPRNQ4KMQ1 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TPRNQ4KMQ1 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
TPRNQ4KMQ1 CROCC-201ENST00000375541 6656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
TPRNQ4KMQ1 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
TPRNQ4KMQ1 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TPRNQ4KMQ1 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
TPRNQ4KMQ1 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TPRNQ4KMQ1 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
TPRNQ4KMQ1 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
TPRNQ4KMQ1 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
TPRNQ4KMQ1 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TPRNQ4KMQ1 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
TPRNQ4KMQ1 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC21.3■■□□□ 1
TPRNQ4KMQ1 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
TPRNQ4KMQ1 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TPRNQ4KMQ1 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TPRNQ4KMQ1 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TPRNQ4KMQ1 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TPRNQ4KMQ1 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
TPRNQ4KMQ1 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TPRNQ4KMQ1 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TPRNQ4KMQ1 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TPRNQ4KMQ1 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
TPRNQ4KMQ1 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TPRNQ4KMQ1 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TPRNQ4KMQ1 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TPRNQ4KMQ1 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TPRNQ4KMQ1 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
TPRNQ4KMQ1 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TPRNQ4KMQ1 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
TPRNQ4KMQ1 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
TPRNQ4KMQ1 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
TPRNQ4KMQ1 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC21.29■■□□□ 1
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