Protein–RNA interactions for Protein: Q3LI58

KRTAP21-1, Keratin-associated protein 21-1, humanhuman

Predictions only

Length 79 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP21-1Q3LI58 SYT17-201ENST00000355377 3081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
KRTAP21-1Q3LI58 LETMD1-201ENST00000262055 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
KRTAP21-1Q3LI58 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
KRTAP21-1Q3LI58 LDLRAD4-205ENST00000585931 2118 ntTSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
KRTAP21-1Q3LI58 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC2.78□□□□□ -1.96
KRTAP21-1Q3LI58 TRAF6-201ENST00000348124 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
KRTAP21-1Q3LI58 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
KRTAP21-1Q3LI58 C20orf166-AS1-203ENST00000475015 2585 ntTSL 2 BASIC2.78□□□□□ -1.96
KRTAP21-1Q3LI58 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
KRTAP21-1Q3LI58 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
KRTAP21-1Q3LI58 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
KRTAP21-1Q3LI58 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
KRTAP21-1Q3LI58 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
KRTAP21-1Q3LI58 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC2.78□□□□□ -1.96
KRTAP21-1Q3LI58 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
KRTAP21-1Q3LI58 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
KRTAP21-1Q3LI58 UBAP1-202ENST00000359544 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
KRTAP21-1Q3LI58 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC2.78□□□□□ -1.96
KRTAP21-1Q3LI58 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
KRTAP21-1Q3LI58 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
KRTAP21-1Q3LI58 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC2.78□□□□□ -1.96
KRTAP21-1Q3LI58 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
KRTAP21-1Q3LI58 VSIG10L-201ENST00000335624 3397 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
KRTAP21-1Q3LI58 IL9R-202ENST00000369423 2032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
KRTAP21-1Q3LI58 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
KRTAP21-1Q3LI58 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
KRTAP21-1Q3LI58 CTNS-202ENST00000381870 2470 ntTSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
KRTAP21-1Q3LI58 KYAT1-205ENST00000436267 2487 ntTSL 2 BASIC2.78□□□□□ -1.96
KRTAP21-1Q3LI58 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
KRTAP21-1Q3LI58 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
KRTAP21-1Q3LI58 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
KRTAP21-1Q3LI58 KCNC3-202ENST00000474951 3347 ntTSL 2 BASIC2.78□□□□□ -1.97
KRTAP21-1Q3LI58 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.97
KRTAP21-1Q3LI58 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.97
KRTAP21-1Q3LI58 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.78□□□□□ -1.97
KRTAP21-1Q3LI58 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.97
KRTAP21-1Q3LI58 ANKLE2-210ENST00000542657 2446 ntTSL 2 BASIC2.78□□□□□ -1.97
KRTAP21-1Q3LI58 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.97
KRTAP21-1Q3LI58 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.78□□□□□ -1.97
KRTAP21-1Q3LI58 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.78□□□□□ -1.97
KRTAP21-1Q3LI58 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC2.78□□□□□ -1.97
KRTAP21-1Q3LI58 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.97
KRTAP21-1Q3LI58 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.97
KRTAP21-1Q3LI58 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.97
KRTAP21-1Q3LI58 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.97
KRTAP21-1Q3LI58 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.97
KRTAP21-1Q3LI58 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.97
KRTAP21-1Q3LI58 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC2.78□□□□□ -1.97
KRTAP21-1Q3LI58 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.97
KRTAP21-1Q3LI58 UBE2I-201ENST00000325437 2832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.78□□□□□ -1.97
KRTAP21-1Q3LI58 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.97
KRTAP21-1Q3LI58 ATP6V1H-201ENST00000355221 2365 ntTSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.97
KRTAP21-1Q3LI58 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.78□□□□□ -1.97
KRTAP21-1Q3LI58 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.97
KRTAP21-1Q3LI58 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.97
KRTAP21-1Q3LI58 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.97
KRTAP21-1Q3LI58 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.97
KRTAP21-1Q3LI58 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC2.78□□□□□ -1.97
KRTAP21-1Q3LI58 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.97
KRTAP21-1Q3LI58 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.97
KRTAP21-1Q3LI58 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.97
KRTAP21-1Q3LI58 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
KRTAP21-1Q3LI58 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
KRTAP21-1Q3LI58 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.77□□□□□ -1.97
KRTAP21-1Q3LI58 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
KRTAP21-1Q3LI58 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
KRTAP21-1Q3LI58 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
KRTAP21-1Q3LI58 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
KRTAP21-1Q3LI58 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
KRTAP21-1Q3LI58 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
KRTAP21-1Q3LI58 LMNA-201ENST00000347559 3137 ntTSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
KRTAP21-1Q3LI58 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
KRTAP21-1Q3LI58 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
KRTAP21-1Q3LI58 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC2.77□□□□□ -1.97
KRTAP21-1Q3LI58 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC2.77□□□□□ -1.97
KRTAP21-1Q3LI58 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
KRTAP21-1Q3LI58 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
KRTAP21-1Q3LI58 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
KRTAP21-1Q3LI58 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
KRTAP21-1Q3LI58 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
KRTAP21-1Q3LI58 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
KRTAP21-1Q3LI58 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
KRTAP21-1Q3LI58 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
KRTAP21-1Q3LI58 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC2.77□□□□□ -1.97
KRTAP21-1Q3LI58 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
KRTAP21-1Q3LI58 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
KRTAP21-1Q3LI58 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.77□□□□□ -1.97
KRTAP21-1Q3LI58 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.77□□□□□ -1.97
KRTAP21-1Q3LI58 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
KRTAP21-1Q3LI58 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
KRTAP21-1Q3LI58 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
KRTAP21-1Q3LI58 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
KRTAP21-1Q3LI58 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
KRTAP21-1Q3LI58 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
KRTAP21-1Q3LI58 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
KRTAP21-1Q3LI58 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC2.77□□□□□ -1.97
KRTAP21-1Q3LI58 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
KRTAP21-1Q3LI58 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
KRTAP21-1Q3LI58 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
KRTAP21-1Q3LI58 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC2.77□□□□□ -1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms