Protein–RNA interactions for Protein: Q3KNV8

PCGF3, Polycomb group RING finger protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCGF3Q3KNV8 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PCGF3Q3KNV8 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PCGF3Q3KNV8 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
PCGF3Q3KNV8 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PCGF3Q3KNV8 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PCGF3Q3KNV8 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PCGF3Q3KNV8 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PCGF3Q3KNV8 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PCGF3Q3KNV8 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PCGF3Q3KNV8 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PCGF3Q3KNV8 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PCGF3Q3KNV8 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PCGF3Q3KNV8 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PCGF3Q3KNV8 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PCGF3Q3KNV8 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PCGF3Q3KNV8 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PCGF3Q3KNV8 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PCGF3Q3KNV8 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PCGF3Q3KNV8 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PCGF3Q3KNV8 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PCGF3Q3KNV8 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PCGF3Q3KNV8 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PCGF3Q3KNV8 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PCGF3Q3KNV8 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PCGF3Q3KNV8 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PCGF3Q3KNV8 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PCGF3Q3KNV8 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PCGF3Q3KNV8 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PCGF3Q3KNV8 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PCGF3Q3KNV8 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PCGF3Q3KNV8 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PCGF3Q3KNV8 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PCGF3Q3KNV8 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PCGF3Q3KNV8 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PCGF3Q3KNV8 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PCGF3Q3KNV8 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PCGF3Q3KNV8 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PCGF3Q3KNV8 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PCGF3Q3KNV8 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PCGF3Q3KNV8 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PCGF3Q3KNV8 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PCGF3Q3KNV8 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PCGF3Q3KNV8 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PCGF3Q3KNV8 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PCGF3Q3KNV8 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PCGF3Q3KNV8 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PCGF3Q3KNV8 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PCGF3Q3KNV8 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PCGF3Q3KNV8 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PCGF3Q3KNV8 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PCGF3Q3KNV8 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PCGF3Q3KNV8 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PCGF3Q3KNV8 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PCGF3Q3KNV8 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PCGF3Q3KNV8 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PCGF3Q3KNV8 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PCGF3Q3KNV8 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PCGF3Q3KNV8 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PCGF3Q3KNV8 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PCGF3Q3KNV8 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PCGF3Q3KNV8 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PCGF3Q3KNV8 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PCGF3Q3KNV8 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PCGF3Q3KNV8 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PCGF3Q3KNV8 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PCGF3Q3KNV8 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PCGF3Q3KNV8 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PCGF3Q3KNV8 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PCGF3Q3KNV8 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PCGF3Q3KNV8 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PCGF3Q3KNV8 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PCGF3Q3KNV8 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PCGF3Q3KNV8 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PCGF3Q3KNV8 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PCGF3Q3KNV8 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PCGF3Q3KNV8 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PCGF3Q3KNV8 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PCGF3Q3KNV8 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PCGF3Q3KNV8 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
PCGF3Q3KNV8 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PCGF3Q3KNV8 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PCGF3Q3KNV8 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PCGF3Q3KNV8 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PCGF3Q3KNV8 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PCGF3Q3KNV8 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PCGF3Q3KNV8 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PCGF3Q3KNV8 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PCGF3Q3KNV8 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PCGF3Q3KNV8 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PCGF3Q3KNV8 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PCGF3Q3KNV8 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PCGF3Q3KNV8 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PCGF3Q3KNV8 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PCGF3Q3KNV8 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PCGF3Q3KNV8 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PCGF3Q3KNV8 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PCGF3Q3KNV8 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PCGF3Q3KNV8 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
PCGF3Q3KNV8 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PCGF3Q3KNV8 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms