Protein–RNA interactions for Protein: Q3BBV2

NBPF8, Putative neuroblastoma breakpoint family member 8, humanhuman

Predictions only

Length 869 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NBPF8Q3BBV2 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
NBPF8Q3BBV2 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
NBPF8Q3BBV2 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
NBPF8Q3BBV2 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
NBPF8Q3BBV2 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
NBPF8Q3BBV2 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
NBPF8Q3BBV2 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
NBPF8Q3BBV2 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
NBPF8Q3BBV2 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
NBPF8Q3BBV2 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
NBPF8Q3BBV2 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
NBPF8Q3BBV2 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
NBPF8Q3BBV2 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
NBPF8Q3BBV2 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
NBPF8Q3BBV2 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
NBPF8Q3BBV2 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
NBPF8Q3BBV2 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
NBPF8Q3BBV2 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
NBPF8Q3BBV2 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
NBPF8Q3BBV2 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
NBPF8Q3BBV2 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
NBPF8Q3BBV2 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
NBPF8Q3BBV2 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
NBPF8Q3BBV2 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
NBPF8Q3BBV2 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
NBPF8Q3BBV2 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
NBPF8Q3BBV2 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
NBPF8Q3BBV2 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
NBPF8Q3BBV2 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
NBPF8Q3BBV2 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
NBPF8Q3BBV2 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
NBPF8Q3BBV2 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
NBPF8Q3BBV2 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
NBPF8Q3BBV2 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
NBPF8Q3BBV2 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
NBPF8Q3BBV2 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
NBPF8Q3BBV2 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
NBPF8Q3BBV2 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
NBPF8Q3BBV2 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
NBPF8Q3BBV2 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
NBPF8Q3BBV2 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
NBPF8Q3BBV2 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
NBPF8Q3BBV2 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
NBPF8Q3BBV2 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
NBPF8Q3BBV2 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
NBPF8Q3BBV2 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
NBPF8Q3BBV2 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
NBPF8Q3BBV2 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
NBPF8Q3BBV2 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC25.61■■□□□ 1.69
NBPF8Q3BBV2 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
NBPF8Q3BBV2 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
NBPF8Q3BBV2 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
NBPF8Q3BBV2 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
NBPF8Q3BBV2 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
NBPF8Q3BBV2 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
NBPF8Q3BBV2 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
NBPF8Q3BBV2 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
NBPF8Q3BBV2 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
NBPF8Q3BBV2 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
NBPF8Q3BBV2 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
NBPF8Q3BBV2 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
NBPF8Q3BBV2 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
NBPF8Q3BBV2 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
NBPF8Q3BBV2 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
NBPF8Q3BBV2 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
NBPF8Q3BBV2 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
NBPF8Q3BBV2 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
NBPF8Q3BBV2 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
NBPF8Q3BBV2 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
NBPF8Q3BBV2 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
NBPF8Q3BBV2 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
NBPF8Q3BBV2 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
NBPF8Q3BBV2 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
NBPF8Q3BBV2 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
NBPF8Q3BBV2 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
NBPF8Q3BBV2 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
NBPF8Q3BBV2 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
NBPF8Q3BBV2 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
NBPF8Q3BBV2 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
NBPF8Q3BBV2 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
NBPF8Q3BBV2 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
NBPF8Q3BBV2 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
NBPF8Q3BBV2 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
NBPF8Q3BBV2 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
NBPF8Q3BBV2 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
NBPF8Q3BBV2 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
NBPF8Q3BBV2 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
NBPF8Q3BBV2 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
NBPF8Q3BBV2 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
NBPF8Q3BBV2 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
NBPF8Q3BBV2 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC25.6■■□□□ 1.69
NBPF8Q3BBV2 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
NBPF8Q3BBV2 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
NBPF8Q3BBV2 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
NBPF8Q3BBV2 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
NBPF8Q3BBV2 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
NBPF8Q3BBV2 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
NBPF8Q3BBV2 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
NBPF8Q3BBV2 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
NBPF8Q3BBV2 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.1 ms