Protein–RNA interactions for Protein: Q32P28

P3H1, Prolyl 3-hydroxylase 1, humanhuman

Predictions only

Length 736 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P3H1Q32P28 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
P3H1Q32P28 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
P3H1Q32P28 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
P3H1Q32P28 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
P3H1Q32P28 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
P3H1Q32P28 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
P3H1Q32P28 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
P3H1Q32P28 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
P3H1Q32P28 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
P3H1Q32P28 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
P3H1Q32P28 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
P3H1Q32P28 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
P3H1Q32P28 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
P3H1Q32P28 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
P3H1Q32P28 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
P3H1Q32P28 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
P3H1Q32P28 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
P3H1Q32P28 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
P3H1Q32P28 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
P3H1Q32P28 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
P3H1Q32P28 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
P3H1Q32P28 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
P3H1Q32P28 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
P3H1Q32P28 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
P3H1Q32P28 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
P3H1Q32P28 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
P3H1Q32P28 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
P3H1Q32P28 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
P3H1Q32P28 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
P3H1Q32P28 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
P3H1Q32P28 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
P3H1Q32P28 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
P3H1Q32P28 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
P3H1Q32P28 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
P3H1Q32P28 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
P3H1Q32P28 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
P3H1Q32P28 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
P3H1Q32P28 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC18.71■□□□□ 0.58
P3H1Q32P28 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
P3H1Q32P28 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
P3H1Q32P28 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
P3H1Q32P28 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
P3H1Q32P28 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
P3H1Q32P28 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
P3H1Q32P28 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
P3H1Q32P28 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
P3H1Q32P28 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
P3H1Q32P28 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
P3H1Q32P28 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
P3H1Q32P28 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
P3H1Q32P28 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
P3H1Q32P28 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
P3H1Q32P28 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
P3H1Q32P28 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
P3H1Q32P28 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
P3H1Q32P28 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
P3H1Q32P28 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC18.7■□□□□ 0.58
P3H1Q32P28 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
P3H1Q32P28 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
P3H1Q32P28 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
P3H1Q32P28 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
P3H1Q32P28 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
P3H1Q32P28 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
P3H1Q32P28 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
P3H1Q32P28 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
P3H1Q32P28 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
P3H1Q32P28 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
P3H1Q32P28 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
P3H1Q32P28 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
P3H1Q32P28 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
P3H1Q32P28 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
P3H1Q32P28 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
P3H1Q32P28 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
P3H1Q32P28 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
P3H1Q32P28 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC18.69■□□□□ 0.58
P3H1Q32P28 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
P3H1Q32P28 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
P3H1Q32P28 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
P3H1Q32P28 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
P3H1Q32P28 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
P3H1Q32P28 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
P3H1Q32P28 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
P3H1Q32P28 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
P3H1Q32P28 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
P3H1Q32P28 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
P3H1Q32P28 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
P3H1Q32P28 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
P3H1Q32P28 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
P3H1Q32P28 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
P3H1Q32P28 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
P3H1Q32P28 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
P3H1Q32P28 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
P3H1Q32P28 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
P3H1Q32P28 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
P3H1Q32P28 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
P3H1Q32P28 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
P3H1Q32P28 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
P3H1Q32P28 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
P3H1Q32P28 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
P3H1Q32P28 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms