Protein–RNA interactions for Protein: Q17RB0

RTL8B, Retrotransposon Gag-like protein 8B, humanhuman

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Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTL8BQ17RB0 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
RTL8BQ17RB0 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
RTL8BQ17RB0 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
RTL8BQ17RB0 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
RTL8BQ17RB0 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
RTL8BQ17RB0 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
RTL8BQ17RB0 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
RTL8BQ17RB0 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
RTL8BQ17RB0 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
RTL8BQ17RB0 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
RTL8BQ17RB0 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
RTL8BQ17RB0 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
RTL8BQ17RB0 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
RTL8BQ17RB0 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
RTL8BQ17RB0 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
RTL8BQ17RB0 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
RTL8BQ17RB0 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
RTL8BQ17RB0 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
RTL8BQ17RB0 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
RTL8BQ17RB0 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
RTL8BQ17RB0 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
RTL8BQ17RB0 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
RTL8BQ17RB0 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
RTL8BQ17RB0 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
RTL8BQ17RB0 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
RTL8BQ17RB0 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
RTL8BQ17RB0 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
RTL8BQ17RB0 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
RTL8BQ17RB0 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
RTL8BQ17RB0 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
RTL8BQ17RB0 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
RTL8BQ17RB0 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
RTL8BQ17RB0 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
RTL8BQ17RB0 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
RTL8BQ17RB0 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
RTL8BQ17RB0 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
RTL8BQ17RB0 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
RTL8BQ17RB0 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
RTL8BQ17RB0 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
RTL8BQ17RB0 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
RTL8BQ17RB0 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
RTL8BQ17RB0 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
RTL8BQ17RB0 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
RTL8BQ17RB0 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
RTL8BQ17RB0 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
RTL8BQ17RB0 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
RTL8BQ17RB0 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
RTL8BQ17RB0 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
RTL8BQ17RB0 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
RTL8BQ17RB0 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
RTL8BQ17RB0 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
RTL8BQ17RB0 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
RTL8BQ17RB0 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
RTL8BQ17RB0 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
RTL8BQ17RB0 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
RTL8BQ17RB0 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
RTL8BQ17RB0 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
RTL8BQ17RB0 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
RTL8BQ17RB0 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC14.79□□□□□ -0.04
RTL8BQ17RB0 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
RTL8BQ17RB0 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
RTL8BQ17RB0 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
RTL8BQ17RB0 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
RTL8BQ17RB0 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
RTL8BQ17RB0 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
RTL8BQ17RB0 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
RTL8BQ17RB0 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
RTL8BQ17RB0 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
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RTL8BQ17RB0 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
RTL8BQ17RB0 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
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RTL8BQ17RB0 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
RTL8BQ17RB0 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
RTL8BQ17RB0 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
RTL8BQ17RB0 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
RTL8BQ17RB0 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
RTL8BQ17RB0 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
RTL8BQ17RB0 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
RTL8BQ17RB0 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
RTL8BQ17RB0 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
RTL8BQ17RB0 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
RTL8BQ17RB0 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
RTL8BQ17RB0 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
RTL8BQ17RB0 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC14.79□□□□□ -0.04
RTL8BQ17RB0 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
RTL8BQ17RB0 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
RTL8BQ17RB0 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
RTL8BQ17RB0 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
RTL8BQ17RB0 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
RTL8BQ17RB0 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
RTL8BQ17RB0 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
RTL8BQ17RB0 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
RTL8BQ17RB0 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
RTL8BQ17RB0 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
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