Protein–RNA interactions for Protein: Q17R55

FAM187B, Protein FAM187B, humanhuman

Predictions only

Length 369 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM187BQ17R55 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
FAM187BQ17R55 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC19.58■□□□□ 0.73
FAM187BQ17R55 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
FAM187BQ17R55 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
FAM187BQ17R55 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
FAM187BQ17R55 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
FAM187BQ17R55 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
FAM187BQ17R55 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
FAM187BQ17R55 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
FAM187BQ17R55 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
FAM187BQ17R55 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
FAM187BQ17R55 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
FAM187BQ17R55 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
FAM187BQ17R55 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
FAM187BQ17R55 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
FAM187BQ17R55 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
FAM187BQ17R55 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
FAM187BQ17R55 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
FAM187BQ17R55 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
FAM187BQ17R55 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
FAM187BQ17R55 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
FAM187BQ17R55 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
FAM187BQ17R55 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
FAM187BQ17R55 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
FAM187BQ17R55 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
FAM187BQ17R55 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
FAM187BQ17R55 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
FAM187BQ17R55 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
FAM187BQ17R55 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
FAM187BQ17R55 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
FAM187BQ17R55 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
FAM187BQ17R55 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
FAM187BQ17R55 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
FAM187BQ17R55 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
FAM187BQ17R55 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
FAM187BQ17R55 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
FAM187BQ17R55 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
FAM187BQ17R55 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.57■□□□□ 0.72
FAM187BQ17R55 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC19.57■□□□□ 0.72
FAM187BQ17R55 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
FAM187BQ17R55 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
FAM187BQ17R55 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
FAM187BQ17R55 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
FAM187BQ17R55 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
FAM187BQ17R55 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
FAM187BQ17R55 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
FAM187BQ17R55 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
FAM187BQ17R55 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
FAM187BQ17R55 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
FAM187BQ17R55 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
FAM187BQ17R55 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
FAM187BQ17R55 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
FAM187BQ17R55 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
FAM187BQ17R55 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
FAM187BQ17R55 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
FAM187BQ17R55 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
FAM187BQ17R55 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
FAM187BQ17R55 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
FAM187BQ17R55 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
FAM187BQ17R55 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
FAM187BQ17R55 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC19.56■□□□□ 0.72
FAM187BQ17R55 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
FAM187BQ17R55 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC19.56■□□□□ 0.72
FAM187BQ17R55 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
FAM187BQ17R55 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
FAM187BQ17R55 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
FAM187BQ17R55 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
FAM187BQ17R55 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
FAM187BQ17R55 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
FAM187BQ17R55 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
FAM187BQ17R55 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
FAM187BQ17R55 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
FAM187BQ17R55 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
FAM187BQ17R55 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
FAM187BQ17R55 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
FAM187BQ17R55 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
FAM187BQ17R55 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
FAM187BQ17R55 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
FAM187BQ17R55 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
FAM187BQ17R55 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
FAM187BQ17R55 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
FAM187BQ17R55 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
FAM187BQ17R55 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
FAM187BQ17R55 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
FAM187BQ17R55 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC19.55■□□□□ 0.72
FAM187BQ17R55 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
FAM187BQ17R55 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
FAM187BQ17R55 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
FAM187BQ17R55 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
FAM187BQ17R55 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
FAM187BQ17R55 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
FAM187BQ17R55 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
FAM187BQ17R55 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
FAM187BQ17R55 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
FAM187BQ17R55 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
FAM187BQ17R55 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
FAM187BQ17R55 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
FAM187BQ17R55 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
FAM187BQ17R55 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
FAM187BQ17R55 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.7 ms