Protein–RNA interactions for Protein: Q16676

FOXD1, Forkhead box protein D1, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD1Q16676 MTND4P25-201ENST00000441039 533 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
FOXD1Q16676 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
FOXD1Q16676 AC090152.1-202ENST00000518993 1079 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
FOXD1Q16676 PTS-202ENST00000524931 696 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
FOXD1Q16676 PTS-204ENST00000525803 625 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
FOXD1Q16676 MS4A6A-210ENST00000529054 1160 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
FOXD1Q16676 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
FOXD1Q16676 C15orf40-209ENST00000538348 561 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
FOXD1Q16676 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
FOXD1Q16676 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
FOXD1Q16676 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC26.8■■□□□ 1.88
FOXD1Q16676 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
FOXD1Q16676 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
FOXD1Q16676 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
FOXD1Q16676 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
FOXD1Q16676 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
FOXD1Q16676 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
FOXD1Q16676 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
FOXD1Q16676 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
FOXD1Q16676 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
FOXD1Q16676 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
FOXD1Q16676 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
FOXD1Q16676 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
FOXD1Q16676 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
FOXD1Q16676 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
FOXD1Q16676 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
FOXD1Q16676 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
FOXD1Q16676 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
FOXD1Q16676 KRTAP4-3-201ENST00000391356 964 ntAPPRIS P1 BASIC26.79■■□□□ 1.88
FOXD1Q16676 TMEM177-203ENST00000409951 1216 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
FOXD1Q16676 FSBP-201ENST00000481490 1158 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
FOXD1Q16676 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC26.79■■□□□ 1.88
FOXD1Q16676 DWORF-201ENST00000489090 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
FOXD1Q16676 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
FOXD1Q16676 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
FOXD1Q16676 SMIM8-207ENST00000608525 735 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
FOXD1Q16676 AL161616.2-201ENST00000622001 565 ntTSL 4 BASIC26.79■■□□□ 1.88
FOXD1Q16676 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
FOXD1Q16676 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
FOXD1Q16676 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
FOXD1Q16676 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
FOXD1Q16676 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
FOXD1Q16676 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
FOXD1Q16676 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
FOXD1Q16676 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
FOXD1Q16676 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
FOXD1Q16676 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
FOXD1Q16676 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
FOXD1Q16676 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
FOXD1Q16676 COA4-201ENST00000355693 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
FOXD1Q16676 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
FOXD1Q16676 MTND3P3-201ENST00000505004 126 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
FOXD1Q16676 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
FOXD1Q16676 AC068408.1-201ENST00000577406 1144 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
FOXD1Q16676 AP005433.1-202ENST00000580845 521 ntTSL 4 BASIC26.78■■□□□ 1.88
FOXD1Q16676 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
FOXD1Q16676 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC26.78■■□□□ 1.88
FOXD1Q16676 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
FOXD1Q16676 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
FOXD1Q16676 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
FOXD1Q16676 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
FOXD1Q16676 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
FOXD1Q16676 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
FOXD1Q16676 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
FOXD1Q16676 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
FOXD1Q16676 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
FOXD1Q16676 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
FOXD1Q16676 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
FOXD1Q16676 RTN1-203ENST00000395090 1609 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
FOXD1Q16676 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
FOXD1Q16676 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
FOXD1Q16676 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
FOXD1Q16676 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
FOXD1Q16676 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
FOXD1Q16676 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
FOXD1Q16676 RPS3AP29-201ENST00000437728 769 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
FOXD1Q16676 AC022973.3-201ENST00000521014 467 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
FOXD1Q16676 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
FOXD1Q16676 AC022616.2-201ENST00000523185 300 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
FOXD1Q16676 AC124312.2-201ENST00000546615 427 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
FOXD1Q16676 AL139021.1-201ENST00000556734 436 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
FOXD1Q16676 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
FOXD1Q16676 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
FOXD1Q16676 AC090246.1-201ENST00000616499 426 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
FOXD1Q16676 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
FOXD1Q16676 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
FOXD1Q16676 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
FOXD1Q16676 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
FOXD1Q16676 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
FOXD1Q16676 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
FOXD1Q16676 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
FOXD1Q16676 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
FOXD1Q16676 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
FOXD1Q16676 LINC00469-201ENST00000321800 708 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
FOXD1Q16676 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
FOXD1Q16676 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
FOXD1Q16676 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
FOXD1Q16676 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
FOXD1Q16676 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
FOXD1Q16676 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.5 ms